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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 请问怎么对Material Studio的Dmol3计算模型做Bader分析
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shuikuliu

金虫 (小有名气)

[求助] 请问怎么对Material Studio的Dmol3计算模型做Bader分析

恳切请教各位高手，怎么对Dmol的计算结果做Bader电荷分析啊，我原来做的只是Mulliken 布居分析，但审稿人建议我做Bader分析。我从网上搜了一下，大部分都是讲Vasp或CASTEP计算的Bader分析的，请不吝赐教啊。ORZ
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闭门造车对搞科研是要不得的，虫友们多多交流啊
1楼 2012-08-10 15:50:08
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xyzzz986

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
xueht987: 金币+1, 鼓励交流！ 2012-08-11 10:52:42
嗯，可能是需要对电子密度进行操作把。

需要自己写程序，把dmol的电子密度写成bader能读得格式，然后剩下的就是回车了。
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shuikuliu
2楼2012-08-11 06:49:53
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shuikuliu

金虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by xyzzz986 at 2012-08-11 06:49:53
嗯，可能是需要对电子密度进行操作把。

需要自己写程序，把dmol的电子密度写成bader能读得格式，然后剩下的就是回车了。

请问您能不能说的更详细一点，怎么将dmol的电子密度写成bader能读得格式啊
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闭门造车对搞科研是要不得的，虫友们多多交流啊
3楼2012-08-11 21:22:35
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xyzzz986

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
xueht987: 金币+1, 多谢指教! 2012-08-13 00:13:14
xueht987: 应助指数+1 2012-08-13 00:13:33
这个你要看看bader都能读哪些格式的电子密度，dmol的电子密度是啥样子的。
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4楼2012-08-12 15:17:27
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stonezhoujun

金虫 (著名写手)
★
sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2012-12-27 20:24:06
我以前也有类似的经历，但是我反驳了审稿人的意见，并列出了相关用Mulli做布局分析的文章，说明Mu布局分析的结果是可信的。最后也接收了！不过，能用Bader 的话最好！
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5楼2012-08-13 22:36:10
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xmr0125

木虫 (正式写手)
★
sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2012-12-27 20:24:13
我是来打酱油的。其实我看论坛上许多帖子也说每一种都不是严格的定量的计算的。而且每一种算法都有其相对应的近似。有的时候论文审稿人的建议不一定都要接受，你只需要给出自己相对的论证即可。
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人生如此！
6楼2012-11-22 11:35:23
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ldxdwn

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2012-12-27 20:24:23
关于Bader电荷计算，我看的一篇文献上用的是vasp计算的bader电荷；后来我问了下MS公司的工程师，他们说MS中密立根电荷就相当于bader电荷，只是milliken电荷属于传统的方法。二者表达出来的结果应该是一样的吧，只不过是计算方法不同而已。建议你看看bader电荷和milliken电荷的不同之处，应该能回复审稿人意见吧……
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7楼2012-12-27 12:49:40
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a94259425

木虫 (小有名气)
你好 我的问题和你的一样 也是只做了Mulliken 布居分析，但是审稿人建议我做Bader分析。
不知道你怎么改的 是根据5楼那样反驳审稿人的意见还是自己又做了bader电荷分析？望共享。。。
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8楼2013-09-02 09:53:04
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Ivy286

木虫 (小有名气)
楼主，我和你的情况一样，我用Dmol3算的Mulliken电荷分析，审稿人让做Bader电荷分析，你当时是怎么做的？反驳了审稿人还是又重新做了Bader电荷，望不吝赐教！
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9楼2016-01-09 16:15:23
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Leonidas_007

金虫 (小有名气)
弱弱请教一下LZ，dmol3里面可以获得键布居吗，我在properties下面的population analysis下面的Mulliken下拉菜单都计算过，只有原子的布居，不知道是不是有什么换算诀窍，求不吝赐教。
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10楼2017-04-25 23:12:47
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