24小时热门版块排行榜    

查看: 4597  |  回复: 9

shuikuliu

金虫 (小有名气)

[求助] 请问怎么对Material Studio的Dmol3计算模型做Bader分析

恳切请教各位高手,怎么对Dmol的计算结果做Bader电荷分析啊,我原来做的只是Mulliken 布居分析,但审稿人建议我做Bader分析。我从网上搜了一下,大部分都是讲Vasp或CASTEP计算的Bader分析的,请不吝赐教啊。ORZ
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

闭门造车对搞科研是要不得的,虫友们多多交流啊
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xyzzz986

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
xueht987: 金币+1, 鼓励交流! 2012-08-11 10:52:42
嗯,可能是需要对电子密度进行操作把。

需要自己写程序,把dmol的电子密度写成bader能读得格式,然后剩下的就是回车了。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2012-08-11 06:49:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shuikuliu

金虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by xyzzz986 at 2012-08-11 06:49:53
嗯,可能是需要对电子密度进行操作把。

需要自己写程序,把dmol的电子密度写成bader能读得格式,然后剩下的就是回车了。

请问您能不能说的更详细一点,怎么将dmol的电子密度写成bader能读得格式啊
闭门造车对搞科研是要不得的,虫友们多多交流啊
3楼2012-08-11 21:22:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xyzzz986

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


xueht987: 金币+1, 多谢指教! 2012-08-13 00:13:14
xueht987: 应助指数+1 2012-08-13 00:13:33
这个你要看看bader都能读哪些格式的电子密度,dmol的电子密度是啥样子的。
4楼2012-08-12 15:17:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stonezhoujun

金虫 (著名写手)


sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2012-12-27 20:24:06
我以前也有类似的经历,但是我反驳了审稿人的意见,并列出了相关用Mulli做布局分析的文章,说明Mu布局分析的结果是可信的。最后也接收了!不过,能用Bader 的话最好!
5楼2012-08-13 22:36:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xmr0125

木虫 (正式写手)


sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2012-12-27 20:24:13
我是来打酱油的。其实我看论坛上许多帖子也说每一种都不是严格的定量的计算的。而且每一种算法都有其相对应的近似。有的时候论文审稿人的建议不一定都要接受,你只需要给出自己相对的论证即可。
人生如此!
6楼2012-11-22 11:35:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ldxdwn

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2012-12-27 20:24:23
关于Bader电荷计算,我看的一篇文献上用的是vasp计算的bader电荷;后来我问了下MS公司的工程师,他们说MS中密立根电荷就相当于bader电荷,只是milliken电荷属于传统的方法。二者表达出来的结果应该是一样的吧,只不过是计算方法不同而已。建议你看看bader电荷和milliken电荷的不同之处,应该能回复审稿人意见吧……
7楼2012-12-27 12:49:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

a94259425

木虫 (小有名气)

你好 我的问题和你的一样 也是只做了Mulliken 布居分析,但是审稿人建议我做Bader分析。
不知道你怎么改的 是根据5楼那样反驳审稿人的意见还是自己又做了bader电荷分析?望共享。。。
8楼2013-09-02 09:53:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Ivy286

木虫 (小有名气)

楼主,我和你的情况一样,我用Dmol3算的Mulliken电荷分析,审稿人让做Bader电荷分析,你当时是怎么做的?反驳了审稿人还是又重新做了Bader电荷,望不吝赐教!
9楼2016-01-09 16:15:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Leonidas_007

金虫 (小有名气)

弱弱请教一下LZ,dmol3里面可以获得键布居吗,我在properties下面的population analysis下面的Mulliken下拉菜单都计算过,只有原子的布居,不知道是不是有什么换算诀窍,求不吝赐教。
10楼2017-04-25 23:12:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 shuikuliu 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 Qj98d49dHFb9 2026-08-25 4/200 2026-08-26 03:08 by cNXvBfCpiZOM
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 7K1CJE38xLG4 2026-08-25 4/200 2026-08-26 02:04 by cNXvBfCpiZOM
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +17 木水思豆 2026-08-25 20/1000 2026-08-26 01:26 by chengyan1220
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +20 羊腰板 2026-08-21 23/1150 2026-08-25 16:34 by zsna
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 22/1100 2026-08-25 15:36 by 医学老男孩
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +5 process2012 2026-08-23 7/350 2026-08-25 09:42 by huixian257
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +7 炎黄贵胄 2026-08-22 8/400 2026-08-25 08:48 by ZJTJZ
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +21 koalala 2026-08-24 24/1200 2026-08-24 19:25 by 家与远方
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +14 ziyangfang 2026-08-19 17/850 2026-08-24 18:37 by 哈哈蛤?
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 让我中一个面上吧! +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 今天放榜吗? +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
信息提示
请填处理意见