应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » gaussian 高性能计算问题
111/2返回列表12下一页
查看: 1721  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

铁甲威虫

银虫 (正式写手)

[求助] gaussian 高性能计算问题

小弟准备用DFT计算一化合物，可能会用到多节点集群机，计算机会可能只有一次，我们要做优化结构、光谱、NMR还有IRC之类的，请问如何设置GJF文件好呢？
还有 %mem=？    %NProcShared=？   %LindaWorkers=？如何设置好？？

集群机配置如下：
XC多节点集群机参数
个数：1主节点+8计算节点
型号：宝德2300+宝德2700D
CPU个数：66核 运算速度 1.6GHz
CPU型号：Intel  clovertown 四核处理器
内存：31G
硬盘：1.4T
OS：rocks 4.2
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

Linux，高斯等相关知识

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-10-16 18:51:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

gongxd325

至尊木虫 (文坛精英)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 铁甲威虫 at 2012-10-17 13:12:06
它的那个一个主节点是什么意思呢？如果只用一个计算节点那不是好浪费？...

集群的主节点作为服务节点，一般不用于计算，多个计算节点可以同时做多个计算，不会浪费的。一个计算用多个节点可以加快计算，但Gaussian的平行计算方式使其的平行计算效率不高，不是节点越多一定越好。用8个核（一般双CPU服务器，就是1个节点）就可以了，内存尽可能大。
赞一下(1人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

铁甲威虫
一个人做点好事并不难难的是一辈子做好事!!!
10楼2012-10-17 13:32:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

zhongshidaxt

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
这个应该是分阶段来做吧，IRC肯定是在优化、反应之后了。。。
赞一下 回复此楼
不求最好，只求更好~
2楼2012-10-17 08:58:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

铁甲威虫

银虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhongshidaxt at 2012-10-17 08:58:20
这个应该是分阶段来做吧，IRC肯定是在优化、反应之后了。。。

那%mem=？    %NProcShared=？   %LindaWorkers=？如何设置好呢？shuaishuai:
赞一下 回复此楼
3楼2012-10-17 12:05:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gongxd325

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你这个计算用1个节点就可以了，跨节点计算效率不高。具体怎么用多个节点，要看集群如何配的，有没有任务提交软件
赞一下 回复此楼
一个人做点好事并不难难的是一辈子做好事!!!
4楼2012-10-17 12:23:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

铁甲威虫

银虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by gongxd325 at 2012-10-17 12:23:09
你这个计算用1个节点就可以了，跨节点计算效率不高。具体怎么用多个节点，要看集群如何配的，有没有任务提交软件

那用多少内存和多少CPU呢？？
赞一下 回复此楼
5楼2012-10-17 12:31:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

铁甲威虫

银虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by gongxd325 at 2012-10-17 12:23:09
你这个计算用1个节点就可以了，跨节点计算效率不高。具体怎么用多个节点，要看集群如何配的，有没有任务提交软件

那个是华工的集群
赞一下 回复此楼
6楼2012-10-17 12:32:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gongxd325

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
铁甲威虫: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2012-10-17 13:08:57
假如只用1个节点，内存不超过一个节点总内存的90%，核数%NProcs就是1个节点的核总数
赞一下 回复此楼
一个人做点好事并不难难的是一辈子做好事!!!
7楼2012-10-17 12:48:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

铁甲威虫

银虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by gongxd325 at 2012-10-17 12:48:25
假如只用1个节点，内存不超过一个节点总内存的90%，核数%NProcs就是1个节点的核总数

感谢，感谢大神，想请教一个弱弱的问题，NMR要在优化之后吗？？
赞一下 回复此楼
8楼2012-10-17 13:08:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

铁甲威虫

银虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by gongxd325 at 2012-10-17 12:48:25
假如只用1个节点，内存不超过一个节点总内存的90%，核数%NProcs就是1个节点的核总数

它的那个一个主节点是什么意思呢？如果只用一个计算节点那不是好浪费？
赞一下 回复此楼
9楼2012-10-17 13:12:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 铁甲威虫 的主题更新
111/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 4/200 2026-09-29 16:54 by yCO1Ll7aHtsw
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 4/200 2026-09-29 16:47 by yCO1Ll7aHtsw
[博后之家] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 16:30 by etmYJ6d2rquH
[论文投稿] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 4/200 2026-09-29 15:15 by etmYJ6d2rquH
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 6/300 2026-09-29 14:41 by etmYJ6d2rquH
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 3/150 2026-09-29 14:30 by etmYJ6d2rquH
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 CfXuS1rDhLYN 2026-09-28 3/150 2026-09-29 14:24 by etmYJ6d2rquH
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 7/350 2026-09-29 14:07 by etmYJ6d2rquH
[公派出国] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 5/250 2026-09-29 13:50 by etmYJ6d2rquH
[教师之家] 某top大学教授说“能够在市场中兑现的能力才是真能力”无比同意！ +8 zju2000 2026-09-26 9/450 2026-09-29 13:47 by ahsoarli
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-29 09:59 by JzYBbHIXWSrW
[教师之家] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 4/200 2026-09-29 09:49 by JzYBbHIXWSrW
[找工作] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 06:28 by ZvyPK8n6Nfki
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-28 23:46 by b8fCuTHqckEt
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 3/150 2026-09-28 23:12 by b8fCuTHqckEt
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-28 22:55 by ez6fGg9abYaj
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 CfXuS1rDhLYN 2026-09-28 4/200 2026-09-28 22:55 by ez6fGg9abYaj
[找工作] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 5/250 2026-09-28 22:32 by ez6fGg9abYaj
[博后之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 3/150 2026-09-28 22:21 by ez6fGg9abYaj
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-28 18:51 by 9lS3ad5oOymn
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭