24小时热门版块排行榜    

查看: 3361  |  回复: 13

ww5945

铁杆木虫 (正式写手)

科研探索者

[求助] 用Gaussian求分子间作用力 已有3人参与

我准备用Gaussian算CO2与乙烷之间的相互作用力,并考虑了BSSE校正。输入命令如下:# b3lyp/6-31+g(d,p) counterpoise=2 nosymm opt(maxcycle=3000) freq geom=connectivity scf=qc 算完也能正常收敛,但是查看结构发现CO2与乙烷之间的距离貌似太远了。请问是什么原因啊? 两分子之间的距离一般是多少才算合理啊?谢谢各位了
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

高斯

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

不谋万世者不足谋一时,不谋全局者不足谋一域
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

zhou2009

版主 (著名写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by ww5945 at 2014-01-13 21:35:28
谢谢你的回答!!!那具体输入的命令行能借我参考一下不?谢谢了...

% chk=D:\G09\G09 in out\CO2\CO2-C3C3.chk
%nprocshared=2
# opt wb97xd/6-311++g(d,p)   pop=full

CO2-CH3CH3

0 1
C                 -1.88330000   -0.00039100   -0.05718100
O                 -1.88970600    1.15624200   -0.05619800
O                 -1.88103200   -1.15687400   -0.05935700
C                  1.65181700   -0.00383800    0.46757500
C                  2.95483600    0.00408200   -0.32695000
H                  1.11225600   -0.94516200    0.33142700
H                  1.83798100    0.11854100    1.53777800
H                  0.99621200    0.81329000    0.15362900
H                  3.49057000    0.94792600   -0.19716200
H                  3.62005000   -0.80161700   -0.00582600
H                  2.76871500   -0.12704200   -1.39607300

这只是一个初步优化的算例。
建议用:CCSD/6-311++g**  density  再作优化计算。
10楼2014-01-13 22:32:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

smutao

禁虫 (著名写手)

感谢参与,应助指数 +1
本帖内容被屏蔽

2楼2014-01-13 14:12:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ww5945

铁杆木虫 (正式写手)

科研探索者

引用回帖:
2楼: Originally posted by smutao at 2014-01-13 14:12:39
楼主确定是分子间作用力?
力?

这样算的难道不是分子间作用力么?
不谋万世者不足谋一时,不谋全局者不足谋一域
3楼2014-01-13 15:23:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

smutao

禁虫 (著名写手)

本帖内容被屏蔽

4楼2014-01-13 15:25:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

绍敏郡主

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
CO2与乙烷之间的作用力本来就很微弱。
而且b3lyp也不太适合算弱相互作用。
5楼2014-01-13 15:30:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ww5945

铁杆木虫 (正式写手)

科研探索者

引用回帖:
5楼: Originally posted by 绍敏郡主 at 2014-01-13 15:30:02
CO2与乙烷之间的作用力本来就很微弱。
而且b3lyp也不太适合算弱相互作用。

是不是用MP2方法算比较好一点??
不谋万世者不足谋一时,不谋全局者不足谋一域
6楼2014-01-13 15:41:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

绍敏郡主

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by ww5945 at 2014-01-13 15:41:57
是不是用MP2方法算比较好一点??...

你的体系很小,可以用ccsd(t)
7楼2014-01-13 16:22:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhou2009

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gkf高: 金币+3 2014-01-13 20:18:22
ww5945: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-01-13 21:31:12
用Gaussian算CO2与乙烷之间的相互作用力,我试着算了一下,考虑到这是分子之间的弱作用,如果是vdW作用, b3lyp是不能胜任的,便用了wb97xd/6-311++g**,它能兼顾氢键和vdW作用。
输入是按氢键组装的,结果优化成了vdW作用。CO2的二O与乙烷一个C上的二氢产生vdW作用,H----O相距约2.9。
7楼说:体系很小,可以用ccsd(t),是好建议,基组也要更大些,这样才有足够的准确性。

[ Last edited by zhou2009 on 2014-1-13 at 21:22 ]
8楼2014-01-13 19:27:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ww5945

铁杆木虫 (正式写手)

科研探索者

引用回帖:
8楼: Originally posted by zhou2009 at 2014-01-13 19:27:40
用Gaussian算CO2与乙烷之间的相互作用力,我试着算了一下,考虑到这是分子之间的弱作用,如果是vdW作用, b3lyp是不能胜任的,便用了wb97xd/6-311++g**,它能兼顾氢键和vdW作用。
输入是按氢键组装的,结果优化成了 ...

谢谢你的回答!!!那具体输入的命令行能借我参考一下不?谢谢了
不谋万世者不足谋一时,不谋全局者不足谋一域
9楼2014-01-13 21:35:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ww5945 的主题更新
信息提示
请填处理意见