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lihongru

金虫 (小有名气)

[求助] Gaussian计算和其他方法得到的热力学数据哪个更准确呢

本人化工出身,在进行小分子有机物在超临界流体中溶解度模拟的时候经常用到化合物的饱和蒸汽压等热力学数据,没有实验数据的情况下我们都是采用基团贡献法(不准确),想问一下Gaussian计算出来的和基团贡献法估算出来的哪个更准确一些呢?
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


★ ★
小红豆(金币+2): 感谢交流 2011-09-16 20:39:02
可以关注一下COSMOtherm程序,在计算化工涉及到的热力学数据上有很多应用。
高斯算出的热力学数据是气相、单一构象、无分子间相互作用下的,和你想要预测的热力学性质间有很大距离。尽管高斯也提供了隐式溶剂模型,但是,这并不能解决你的问题。
6楼2011-09-09 18:14:44
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


★ ★ ★
zhou2009(金币+3): 2011-09-17 10:18:48
引用回帖:
7楼: Originally posted by lihongru at 2011-09-13 15:11:41:
谢谢sobereva的回答,既然不能直接用Gaussian计算化合物的热力学性质,作为分子描述来关联热力学性质也不错,我以前都用基团贡献法来关联的,现在想用Gaussian法作为分子描述来关联一下我感兴趣化合物的热力学性质。

恩,高斯没法直接算,但做出关联是可以的。另外有些重要描述符没法用Gaussian等量化程序直接给出,但是可以用Gaussian算出来的数据由第三方软件进行进一步分析得到,最值得一提的是general interaction properties function (GIPF),见J. Mol. Struct.(THEOCHEM),307,55及Encyclopedia of Computational Chemistry的Electrostatic Potentials: Chemical Applications条目。GIPF将分子表面性质(分子表面积、表面静电势最大/最小值、表面静电势方差等等)和分子宏观性质(溶解度、沸点、升华热、临界温度等等)关联了起来。分子表面性质可以通过高斯生成静电势和电子密度格点文件,再用GsGrid或WFA(见J. Mol. Model. 16, 1679 (2010))等程序分析得到。
9楼2011-09-16 11:27:59
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普通回帖

lihongru

金虫 (小有名气)

为什么没有人回答呢,是不是问题太菜鸟了?
2楼2011-09-09 09:09:57
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fatpig8832

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★
gmy1990(金币+2): 2011-09-09 12:56:24
引用回帖:
2楼: Originally posted by lihongru at 2011-09-09 09:09:57:
为什么没有人回答呢,是不是问题太菜鸟了?

不是问题太菜鸟,而是太冷门了...

要想回答出你这个问题,至少要有一个人同时做过你的那种方法和gaussian计算,才能得出比较;这里做过gaussian的很多,用过你那种方法的我估计没有,或者只有很少人...所以没人能回答什么...
3楼2011-09-09 12:54:17
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lihongru

金虫 (小有名气)

请教一下Gaussian可以用来估算有机化合物的热力学参数吧,是不是准确度比较差,有没有大虾进行过估算数值与实验数值比较的呢?
4楼2011-09-09 14:15:22
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


★ ★ ★ ★
zhou2009(金币+4): 2011-09-17 10:17:53
你说的这些性质是无法直接通过高斯计算的,因为它们涉及到凝聚相大量分子间复杂的相互作用,这超出了高斯能够处理的范畴。但高斯能够计算的数据可以作为分子描述符,成为构建QSPR方程的一部分,帮助预测这些性质。
如果需要更高精度的计算这些性质,可以用分子动力学、蒙特卡罗模拟,当然,这是很耗时的。
另外,基团加和法并不是唯一预测这些性质的方法,QSPR、神经网络、数据库相似性搜索等等方法都可以用于这些性质的预测,不同研究者也提供了不同的具体实现方案和不同的参数,不妨搜搜文献,比较不同程序给出的结果,应该能找到比你目前使用的更好的方法。
5楼2011-09-09 17:47:49
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lihongru

金虫 (小有名气)

谢谢sobereva的回答,既然不能直接用Gaussian计算化合物的热力学性质,作为分子描述来关联热力学性质也不错,我以前都用基团贡献法来关联的,现在想用Gaussian法作为分子描述来关联一下我感兴趣化合物的热力学性质。
7楼2011-09-13 15:11:41
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gengcy

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
lihongru(金币+12): 要详细点就更好了 2011-09-16 17:13:31
小红豆(金币+2): 感谢交流 2011-09-16 20:39:24
Gaussian算得比较准,但是也取决于用什么方法和基组算,对于不同的物质,可能用的方法和基组不同,需要先和实验值比较。另外,对于金属元素,高斯中的量化方法处理得好像不是很好,也会遇到结果不好的情况。总之,具体问题具体分析吧
8楼2011-09-16 10:25:56
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lihongru

金虫 (小有名气)

我对分子的表面性质非常感兴趣,但我是做实验热力学的,对量化很陌生,我想问一下分子的表面性质都有哪些呢?另外再用Gaussian计算时对于结构很明确的化合物如:水杨酸,还要不要进行结构优化呢?
10楼2011-09-16 17:11:33
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