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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 高斯计算分子间相互作用
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linyusuc

银虫 (小有名气)

[求助] 高斯计算分子间相互作用

请教各位大侠们，高斯软件可以计算分子之间的相互作用能吗，可以计算汽化热吗，当前计算这两个量缩使用的计算方法一般是什么，或者可以推荐一下其他的软件关于介绍着方面的，有什么参考的教程或者其他的资源能否学习一下呢，首先先谢谢大家的积极帮助哦！

不胜感激！
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1楼 2013-11-10 08:43:34
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linyusuc

银虫 (小有名气)
我说的分子间相互作用指的是分子间相互作用的总和，也就是说随后为了进行汽化焓的计算，以便与实验上所获得的汽化焓数值进行比较！

也就是说，就是为了获得能与实验上的汽化焓进行比较的分子间相互作用能的计算！
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3楼2013-11-10 15:39:16
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Voland

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by linyusuc at 2013-11-11 10:19:58
呵呵，谢谢你的积极帮助，那么我想问的是，你看我这样计算是正确的吗，使用两个分子单独的能量减去二者在一起的能量，或者分子之间的相互作用能；那么如果采用三个分子也按照这种方法进行计算，最终的对应于实验上 ...

这怎么说……两个分子和三个分子之间的弱作用，理所当然会因为体系复杂化的原因有所不同，但是我觉得这些数据都可以作为参考标准，少量分子是这么做的，大量分子也是这么做的，不过后者可能具有一种类似于宏观的普适意义吧。
另外，你需要除以的不是分子数目，而是N-1或者N(N-1)/2吧。
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Yağma！Yağma！Yağma！
7楼2013-11-11 16:40:59
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Voland

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
linyusuc: 金币+3, 感谢您的积极帮助！ 2013-11-10 15:37:12
gmy1990: 金币+2 2013-11-10 19:15:38
linyusuc: 金币+7, ★★★★★最佳答案, 感谢你一直的积极帮助！ 2013-11-12 07:01:08
你是说哪种分子间相互作用啊……
氢键，能量表征Gaussian可以算，常用MP2/aug-cc-pvdz，很慢，B3LYP方法不适用。波函数电子密度表征算出波函数之后用Multiwfn吧。
库仑力，你学过高中物理就应该会这个问题。
范德瓦尔斯力，这个用Gaussian似乎不行，分子力场还差不多。
π-π堆积，没算过不清楚。
汽化热……你应该知道热力学，汽化热按照反应方程式去进行扣除就行了。只需要一系列能量和焓就行，用Gaussian无压力。
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Yağma！Yağma！Yağma！
2楼2013-11-10 12:55:01
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Voland

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by linyusuc at 2013-11-10 15:39:16
我说的分子间相互作用指的是分子间相互作用的总和，也就是说随后为了进行汽化焓的计算，以便与实验上所获得的汽化焓数值进行比较！

也就是说，就是为了获得能与实验上的汽化焓进行比较的分子间相互作用能的计算！

那你算能量就行了，用MP2/aug-cc-pvdz。
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4楼2013-11-10 16:01:30
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linyusuc

银虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by Voland at 2013-11-10 16:01:30
那你算能量就行了，用MP2/aug-cc-pvdz。...

呵呵，谢谢你的积极帮助，那么我想问的是，你看我这样计算是正确的吗，使用两个分子单独的能量减去二者在一起的能量，或者分子之间的相互作用能；那么如果采用三个分子也按照这种方法进行计算，最终的对应于实验上的汽化焓数据，还需要将计算所获得的能量除以我所采用的分子的数目吗，不然的话，计算的结果将很大程度上取决于我所采用的分子的数目呀！
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5楼2013-11-11 10:19:58
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linyusuc

银虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by Voland at 2013-11-10 16:01:30
那你算能量就行了，用MP2/aug-cc-pvdz。...

呵呵，谢谢你的积极帮助，那么我想问的是，你看我这样计算是正确的吗，使用两个分子单独的能量减去二者在一起的能量，或者分子之间的相互作用能；那么如果采用三个分子也按照这种方法进行计算，最终的对应于实验上的汽化焓数据，还需要将计算所获得的能量除以我所采用的分子的数目吗，不然的话，计算的结果将很大程度上取决于我所采用的分子的数目呀！
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6楼2013-11-11 10:20:05
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linyusuc

银虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by Voland at 2013-11-11 16:40:59
这怎么说……两个分子和三个分子之间的弱作用，理所当然会因为体系复杂化的原因有所不同，但是我觉得这些数据都可以作为参考标准，少量分子是这么做的，大量分子也是这么做的，不过后者可能具有一种类似于宏观的普 ...

你好，我还想问的一个问题是，为什么在与实验上的汽化焓进行比较的时候，都是采用单分子汽化热+RT的数值，与实验上的数值进行比较呢？难道实验上获得都是单个分子汽化所需要的能量吗，这个能实现吗，实验上怎么能控制单个分子汽化呢？ 总的来说，我对于计算上的汽化焓与实验数值的对比理解的并不好，还望你帮帮我！
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8楼2013-11-12 07:03:59
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Voland

金虫 (小有名气)
我想确定一点，你用理论方法测出来的是汽化焓H还是汽化热力学能U？
如果是前者，我觉得这个我理解不了，如果都是汽化焓，没理由需要再加一个RT。
如果是汽化热力学能U，这个，H-U=RT，实验所测的是焓变，所以需要加RT。
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Yağma！Yağma！Yağma！
9楼2013-11-12 12:31:57
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linyusuc

银虫 (小有名气)
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9楼: Originally posted by Voland at 2013-11-12 12:31:57
我想确定一点，你用理论方法测出来的是汽化焓H还是汽化热力学能U？
如果是前者，我觉得这个我理解不了，如果都是汽化焓，没理由需要再加一个RT。
如果是汽化热力学能U，这个，H-U=RT，实验所测的是焓变，所以需要 ...

你好，我看文献中给出的就是使用分子之间的相互作用能作为汽化热力学能U，之后加上RT就作为汽化焓H，这样的话就与实验上的数值进行对比，但是我发现在计算的时候，不同的分子个数获得的分子间相互作用并不是一致的，差别还很大，所以就不是很清楚上面的U应该使用哪类体系获得？需要除以分子的数目作为平均呢,还是其他的处理方法？另外H-U=RT，其中RT前面的n为1，是不是就说明了采用的是单一的一个分子呢？ 不是很理解，请您指正！ 深表感激
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10楼2013-11-13 07:27:29
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