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【资源】gaussian的优化out文件和gaussian view显示的键长结果不一样已有1人参与
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我用gaussian对半乳糖进行AM1计算后，输出文件显示的键长数据和用gaussian view显示的不一样，这是为何。比如下面的C1-C2键长在gaussian view中是1.53838.但在下面的gaussian输出文件中是1.523308.这是为何？ Distance matrix (angstroms): 1 2 3 4 5 1 C 0.000000 2 C 1.523038 0.000000 3 C 2.487067 1.523067 0.000000 4 C 2.814002 2.487068 1.523003 0.000000 5 O 2.359973 2.833625 2.363812 1.404976 0.000000 6 C 1.523005 2.487091 2.815418 2.252877 1.402067 7 O 3.251262 2.848440 2.395805 1.401977 2.298103 8 H 4.254789 3.843216 2.503680 1.522993 2.407598 9 H 3.024542 2.486705 1.522927 2.486739 2.809068 10 O 3.713332 2.389425 1.402027 2.389408 3.593622 11 O 2.388961 1.401983 2.389004 3.712947 4.032236 12 H 2.487172 1.522975 2.487233 3.025696 3.616962 13 H 1.523033 2.486778 3.824723 4.163483 3.701486 14 O 1.402028 2.389451 2.956483 3.440098 2.740260 15 C 2.494254 3.837414 4.248677 3.609492 2.396203 16 H 2.504586 2.932696 3.340874 2.598631 2.406106 17 O 3.470289 4.678862 5.187089 4.378672 3.372026 18 H 3.895324 3.720317 3.282165 2.042877 2.630547 19 H 4.130833 2.687773 2.043016 3.276986 4.380776 20 H 3.276611 2.042935 2.687480 4.130654 4.690345 21 H 2.043045 3.277056 3.813153 4.074174 3.103880 22 H 3.230431 4.484121 4.568739 3.758872 2.386876 23 H 2.443380 3.953315 4.618478 4.311911 3.131972 24 H 4.276315 5.562921 6.089341 5.268862 4.185469 [ Last edited by Hansongtao on 2010-8-25 at 14:00 ] |
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2楼2010-08-25 14:01:43
回复2楼
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你的距离矩阵是对应着优化后的数据吗？ 本文来自: 小木虫论坛 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2331867&pid=1864707&page=1#pid1864707 我的距离矩阵是对应着优化后的数据。 |
3楼2010-08-29 08:46:54