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emma立夏

铁虫 (初入文坛)

[求助] 双酶切连TA后切不开

各位大侠,这里看~~~
一、我的目的片段已经与pMD-18Tsimple vector连接上之后,挑菌落pcr有目的条带呈阳性。
二、然后提质粒之后做双酶切。可是却切不开。用的是EcoR l 和Sal l两种酶,我做的是20ul体系,反应3h,37°c,水浴。
三、电泳结果,与未酶切的质粒条带做对比,条带跑到后面,EcoR l 单酶切了,但是Sal l与没有酶切组相同。
我考虑的问题:
因为我的pcr引物自加上了这两种酶切位点,但是当时没有考虑到保护碱基的特异性,都只是在酶切位点后加了一个A。是不是这个引物设计的时候出现问题了?
PS:酶活应该是没有问题的,因为用来切过实验室的其他载体,能切开的。
现在想要扩增这个片段,然后插入表达载体,但是一直切不开,很痛苦,做了一个多月了。大家请帮帮忙,八仙过海各显神通~~~本人不胜感激~!
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huguangdong

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你这个问题和保护碱基没关系,连接到T载体酶切效果比加保护碱基要好很多。PCR用的是TAQ酶吧?如果是,就直接做TA克隆,用的是哪个公司的酶?酶切效率也是问题,再就是看看水浴锅温度,用温度计测一下。还有你说你挑的菌落是阳性,用PCR来做验证是不可靠的,最可靠的是测序,别浪费时间和精力了。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

8楼2012-05-03 09:50:41
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