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w090124108

金虫 (小有名气)

[求助] 求助..同一个目不同科的测序结果完全一样,怎么办!!我的金币不太多,望高手指导!!

我提取了一个科的虫子的DNA,经过测序比对之后,在ncbi基因数据库内blast后,发现和另外一个科的虫子达到99%相似度。

怎么办??
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liuqiuning

木虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

co1 同源性本来就很高,这不奇怪,正常!你要是扩增其他片段 差异就比较大了!
5楼2012-07-12 09:16:07
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starseacow

专家顾问 (职业作家)

楼主比对的是哪个片段?
植物生理群69993869,为避免广告,申请加入请提供木虫昵称,院校及专业信息
2楼2012-04-19 18:02:05
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w090124108

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by starseacow at 2012-04-19 18:02:05:
楼主比对的是哪个片段?

你好!

我是用 co1 一段序列扩增的,我和数据库内同一个科的昆虫,且均用co1序列扩增的序列多重比较了,但是相差甚多;

用数据库的blast功能,和另外一个科的昆虫序列高度一致,相似度最高99%。而且在blast结果内,没有其他科的昆虫,也没有该科的其他昆虫。

虽然我知道co1序列非常保守。但是,我觉得现在做到的这个结果有些太离谱了。。

求指导!!我该怎么办?!
3楼2012-04-19 23:23:36
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w090124108

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by starseacow at 2012-04-19 18:02:05:
楼主比对的是哪个片段?

你好!

我是用 co1 一段序列扩增的,我和数据库内同一个科的昆虫,且均用co1序列扩增的序列多重比较了,但是相差甚多;

用数据库的blast功能,和另外一个科的昆虫序列高度一致,相似度最高99%。而且在blast结果内,没有其他科的昆虫,也没有该科的其他昆虫。

虽然我知道co1序列非常保守。但是,我觉得现在做到的这个结果有些太离谱了。。

求指导!!我该怎么办?!
4楼2012-04-20 10:46:01
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