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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 求助..同一个目不同科的测序结果完全一样，怎么办！！我的金币不太多，望高手指导！！
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w090124108

金虫 (小有名气)

[求助] 求助..同一个目不同科的测序结果完全一样，怎么办！！我的金币不太多，望高手指导！！

我提取了一个科的虫子的DNA，经过测序比对之后，在ncbi基因数据库内blast后，发现和另外一个科的虫子达到99%相似度。

怎么办？？
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1楼 2012-04-19 16:36:14
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w090124108

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by starseacow at 2012-04-19 18:02:05:
楼主比对的是哪个片段？

你好！

我是用 co1 一段序列扩增的，我和数据库内同一个科的昆虫，且均用co1序列扩增的序列多重比较了，但是相差甚多；

用数据库的blast功能，和另外一个科的昆虫序列高度一致，相似度最高99%。而且在blast结果内，没有其他科的昆虫，也没有该科的其他昆虫。

虽然我知道co1序列非常保守。但是，我觉得现在做到的这个结果有些太离谱了。。

求指导！！我该怎么办？！
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3楼2012-04-19 23:23:36
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starseacow

专家顾问 (职业作家)
楼主比对的是哪个片段？
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植物生理群69993869，为避免广告，申请加入请提供木虫昵称，院校及专业信息
2楼2012-04-19 18:02:05
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w090124108

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by starseacow at 2012-04-19 18:02:05:
楼主比对的是哪个片段？

你好！

我是用 co1 一段序列扩增的，我和数据库内同一个科的昆虫，且均用co1序列扩增的序列多重比较了，但是相差甚多；

用数据库的blast功能，和另外一个科的昆虫序列高度一致，相似度最高99%。而且在blast结果内，没有其他科的昆虫，也没有该科的其他昆虫。

虽然我知道co1序列非常保守。但是，我觉得现在做到的这个结果有些太离谱了。。

求指导！！我该怎么办？！
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4楼2012-04-20 10:46:01
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liuqiuning

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

co1 同源性本来就很高，这不奇怪，正常！你要是扩增其他片段 差异就比较大了！
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5楼2012-07-12 09:16:07
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