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求助..同一个目不同科的测序结果完全一样,怎么办!!我的金币不太多,望高手指导!!
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w090124108
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[
求助
]
求助..同一个目不同科的测序结果完全一样,怎么办!!我的金币不太多,望高手指导!!
我提取了一个科的虫子的DNA,经过测序比对之后,在ncbi基因数据库内blast后,发现和另外一个科的虫子达到99%相似度。
怎么办??
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1楼
2012-04-19 16:36:14
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starseacow
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2楼
2012-04-19 18:02:05
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w090124108
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2楼
:
Originally posted by
starseacow
at 2012-04-19 18:02:05:
楼主比对的是哪个片段?
你好!
我是用 co1 一段序列扩增的,我和数据库内同一个科的昆虫,且均用co1序列扩增的序列多重比较了,但是相差甚多;
用数据库的blast功能,和另外一个科的昆虫序列高度一致,相似度最高99%。而且在blast结果内,没有其他科的昆虫,也没有该科的其他昆虫。
虽然我知道co1序列非常保守。但是,我觉得现在做到的这个结果有些太离谱了。。
求指导!!我该怎么办?!
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3楼
2012-04-19 23:23:36
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引用回帖:
2楼
:
Originally posted by
starseacow
at 2012-04-19 18:02:05:
楼主比对的是哪个片段?
你好!
我是用 co1 一段序列扩增的,我和数据库内同一个科的昆虫,且均用co1序列扩增的序列多重比较了,但是相差甚多;
用数据库的blast功能,和另外一个科的昆虫序列高度一致,相似度最高99%。而且在blast结果内,没有其他科的昆虫,也没有该科的其他昆虫。
虽然我知道co1序列非常保守。但是,我觉得现在做到的这个结果有些太离谱了。。
求指导!!我该怎么办?!
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4楼
2012-04-20 10:46:01
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liuqiuning
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【答案】应助回帖
co1 同源性本来就很高,这不奇怪,正常!你要是扩增其他片段 差异就比较大了!
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5楼
2012-07-12 09:16:07
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