24小时热门版块排行榜    

查看: 2906  |  回复: 11

cfmzxf84

木虫 (正式写手)

[求助] 同源建模,希望建的蛋白质结构,N端和C端分别使用不同的蛋白模版,请教

对1LCI这个蛋白质建模。
1LCI是蛋白质的完整结构(残基3~550),3IES是其N端与小分子结合之后的结构(残基3~437)
现在我希望N端和3IES完全一样,C端(残基437之后)则根据1LCI来构建
请问用什么软件,怎么做呢?
谢谢大家
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : 1LCI.fasta.txt
  • 2012-03-05 11:29:47, 586 bytes
  • 附件 2 : 1LCI_nowater.pdb
  • 2012-03-05 11:29:49, 671.69 K
  • 附件 3 : 3IES_nowater.pdb
  • 2012-03-05 11:29:50, 547.7 K

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

精华帖转载

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

godcook

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong(金币+3): 鼓励交流 2012-03-05 14:36:01
把437以后的片段序列切出来,用easymodeller模建,采用1LCI作为模板。建出来的结构接到3IES。
个人想法,仅供参考。
2楼2012-03-05 11:35:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

leo1252

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2012-03-06 09:04:24
你手头有什么软件,很多软件都 可以这样模建的,首先先将两个模板相似的地方进行alignment,然后就可以选取不同区域建模了啊~~~~~~~~
3楼2012-03-06 00:32:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cfmzxf84

木虫 (正式写手)

引用回帖:
: Originally posted by leo1252 at 2012-03-06 00:32:22:
你手头有什么软件,很多软件都 可以这样模建的,首先先将两个模板相似的地方进行alignment,然后就可以选取不同区域建模了啊~~~~~~~~

建模的软件我手头有discovery studio , modeller,具体怎么操作呢? 哪个软件比较方便?谢谢
4楼2012-03-06 08:49:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

leo1252

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by cfmzxf84 at 2012-03-06 08:49:49:
建模的软件我手头有discovery studio , modeller,具体怎么操作呢? 哪个软件比较方便?谢谢

Actually, they were based on the same thing (modeller). You can used multiple template using DS.
5楼2012-03-06 16:32:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cfmzxf84

木虫 (正式写手)

引用回帖:
: Originally posted by leo1252 at 2012-03-06 16:32:07:
Actually, they were based on the same thing (modeller). You can used multiple template using DS.

谢谢啊,我用modeller+easymodeller,可以多模版建模了。但是不知道怎么操作软件来选取不同区域?
6楼2012-03-07 08:58:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ghs25372216

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

7楼2012-05-18 21:39:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ghs25372216

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

8楼2012-05-18 21:39:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ghs25372216

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

9楼2012-05-19 19:58:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cfmzxf84

木虫 (正式写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by ghs25372216 at 2012-05-19 19:58:48:
你建模问题解决了吗?我也遇到了和你同样的问题,能教教我吗?

我也没有解决啊
10楼2012-05-19 22:26:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 cfmzxf84 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料类考研调剂 +3 gemmgemm 2026-03-01 4/200 2026-03-02 20:02 by hypershenger
[考研] 考研复试调剂,过国家线的同学都可报名 +5 黑!在干嘛 2026-02-28 6/300 2026-03-02 19:30 by Dismas001
[考研] 085600 英一数二272求调剂 5+6 vida_a 2026-03-01 16/800 2026-03-02 19:13 by zhukairuo
[考研] 289求调剂 +8 yang婷 2026-03-02 9/450 2026-03-02 19:08 by zhukairuo
[考研] 高分子化学与物理调剂 +6 好好好1233 2026-02-28 15/750 2026-03-02 18:47 by caszguilin
[考研] 299求调剂 +4 kkcoco25 2026-03-02 4/200 2026-03-02 18:04 by barlinike
[考研] 一志愿东北大学化学314分求调剂 +3 lr1212.. 2026-03-02 3/150 2026-03-02 17:36 by yeahyou
[考研] 清华大学 材料与化工 353分求调剂 +4 awaystay 2026-03-02 5/250 2026-03-02 17:33 by yeahyou
[考研] 一志愿东北大学材料专硕328,求调剂 +3 shs1083 2026-03-02 3/150 2026-03-02 17:27 by houyaoxu
[考博] 诚招农业博士 +3 心欣向荣 2026-02-28 3/150 2026-03-02 13:33 by 时间不狗
[基金申请] 成果系统访问量大,请15分钟后再尝试。由此给您造成的不便,敬请谅解。 +5 xhuama 2026-03-02 5/250 2026-03-02 12:34 by stidwellNK
[考研] 295求调剂 +8 19171856320 2026-02-28 8/400 2026-03-02 11:19 by yuchj
[基金申请] 此成果不能导入原因:元数据必填信息不完整,可 进行补充。 +4 Kittylucky 2026-03-02 5/250 2026-03-02 11:07 by jurkat.1640
[考研] 材料类求调剂 +11 wana_kiko 2026-02-28 14/700 2026-03-02 08:46 by 聪明的大松鼠
[考研] 299求调剂 +3 Y墨明棋妙Y 2026-02-28 5/250 2026-03-01 21:01 by tangxiaotian
[考研] 298求调剂 +6 axyz3 2026-02-28 6/300 2026-03-01 19:00 by 18137688336
[考博] 26申博 +4 想申博! 2026-02-26 6/300 2026-03-01 17:32 by 想申博!
[考研] 304求调剂 +6 曼殊2266 2026-02-28 7/350 2026-03-01 15:14 by wjLi2017
[考研] 317一志愿华南理工电气工程求调剂 +6 Soliloquy_Q 2026-02-28 11/550 2026-03-01 11:14 by 歌liekkas
[论文投稿] 求助coordination chemistry reviews 的写作模板 10+3 ljplijiapeng 2026-02-27 4/200 2026-03-01 09:07 by babero
信息提示
请填处理意见