24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2969  |  回复: 11
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

cfmzxf84

木虫 (正式写手)

[求助] 同源建模,希望建的蛋白质结构,N端和C端分别使用不同的蛋白模版,请教

对1LCI这个蛋白质建模。
1LCI是蛋白质的完整结构(残基3~550),3IES是其N端与小分子结合之后的结构(残基3~437)
现在我希望N端和3IES完全一样,C端(残基437之后)则根据1LCI来构建
请问用什么软件,怎么做呢?
谢谢大家
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : 1LCI.fasta.txt
  • 2012-03-05 11:29:47, 586 bytes
  • 附件 2 : 1LCI_nowater.pdb
  • 2012-03-05 11:29:49, 671.69 K
  • 附件 3 : 3IES_nowater.pdb
  • 2012-03-05 11:29:50, 547.7 K

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

精华帖转载

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cfmzxf84

木虫 (正式写手)

引用回帖:
: Originally posted by leo1252 at 2012-03-06 00:32:22:
你手头有什么软件,很多软件都 可以这样模建的,首先先将两个模板相似的地方进行alignment,然后就可以选取不同区域建模了啊~~~~~~~~

建模的软件我手头有discovery studio , modeller,具体怎么操作呢? 哪个软件比较方便?谢谢
4楼2012-03-06 08:49:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

godcook

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong(金币+3): 鼓励交流 2012-03-05 14:36:01
把437以后的片段序列切出来,用easymodeller模建,采用1LCI作为模板。建出来的结构接到3IES。
个人想法,仅供参考。
2楼2012-03-05 11:35:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

leo1252

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2012-03-06 09:04:24
你手头有什么软件,很多软件都 可以这样模建的,首先先将两个模板相似的地方进行alignment,然后就可以选取不同区域建模了啊~~~~~~~~
3楼2012-03-06 00:32:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

leo1252

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by cfmzxf84 at 2012-03-06 08:49:49:
建模的软件我手头有discovery studio , modeller,具体怎么操作呢? 哪个软件比较方便?谢谢

Actually, they were based on the same thing (modeller). You can used multiple template using DS.
5楼2012-03-06 16:32:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 化工调剂求导师收留!一志愿失利,踏实肯干,有植物提取科研经历 +20 yzyzx 2026-04-09 21/1050 2026-04-12 00:12 by 小小小小啦啦啦
[考研] 290调剂生物0860 +17 哇哈哈,。 2026-04-11 19/950 2026-04-11 20:20 by dongdian1
[考研] 283求调剂 086004考英二数二 +17 那个噜子 2026-04-10 18/900 2026-04-11 16:27 by 明月此时有
[考研] 311求调剂 +13 xyp想读书 2026-04-10 14/700 2026-04-11 09:41 by 猪会飞
[考研] 284求调剂 +19 梵@@ 2026-04-06 21/1050 2026-04-10 21:12 by zhouxiaoyu
[考研] 287求调剂 +15 Fnhc 2026-04-07 21/1050 2026-04-10 19:09 by chemisry
[考研] 求调剂 +5 不会飞的鱼@ 2026-04-10 5/250 2026-04-10 19:07 by chemisry
[硕博家园] 0856材料化工求调剂,一志愿211,初试成绩349 +5 江淮北月 2026-04-05 5/250 2026-04-10 16:26 by 高维春
[考研] 314求调剂 +23 wakeluofu 2026-04-09 24/1200 2026-04-10 15:31 by MOF_Catal
[考研] 282,电气工程专业,求调剂,不挑专业 +9 jggshjkkm 2026-04-10 9/450 2026-04-10 14:55 by 逆水乘风
[考研] 085404,285分求调剂 +12 薇薇考研 2026-04-07 14/700 2026-04-09 23:10 by parmtree
[考研] 调剂 +12 月@163.com 2026-04-08 12/600 2026-04-09 14:27 by rl1980
[考研] 一志愿0807 数一英一 313 有没有二轮调剂 +11 emokidd 2026-04-08 12/600 2026-04-09 09:24 by wyf236
[考研] 二次调剂求老师收留 +3 笑笑袁 2026-04-08 3/150 2026-04-08 23:50 by 醉在风里
[考研] 机械专硕273请求调剂 +6 庚申壬申 2026-04-07 6/300 2026-04-08 22:41 by bljnqdcc
[考研] 考研求调剂 +4 雯??? 2026-04-08 4/200 2026-04-08 21:44 by 土木硕士招生
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +5 崔wj 2026-04-05 5/250 2026-04-06 15:40 by lin-da
[考研] 一志愿河北工业大学材料工程,初试344求专硕调剂 +6 15933906766 2026-04-05 6/300 2026-04-06 13:21 by 无际的草原
[考研] 一志愿武汉理工大学080200机械工程308分,求调剂 +4 终不似从前 2026-04-05 4/200 2026-04-06 11:46 by 考研学校招点人
[考研] 调剂 +3 李广火 2026-04-05 3/150 2026-04-05 18:57 by 蓝云思雨
信息提示
请填处理意见