应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 要P一段基因全长，已知CDS，怎么设计引物啊？
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
111/2返回列表12下一页
查看: 8381  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

btx362237729

金虫 (正式写手)

[求助] 要P一段基因全长，已知CDS，怎么设计引物啊？

新手 没用过primer，发现这个软件貌似不能设计全长引物。。。真是恼火~
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
人生最黑暗的时光终于过去了
1楼 2012-01-19 21:09:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
参照楼上。
如果参照楼上设计引物不好用，就只有在CDS中间设计引物，获得序列后再用RACE获得全长。
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2012-01-20 09:32:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

西瓜

荣誉版主 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
btx362237729(金币+5): ★★★★★最佳答案 楼上的各位都很好，版主的回答给我极大的信心 非常感谢! 2012-01-21 01:04:01
btx362237729: 回帖置顶 2012-01-21 01:04:08
扩增CDS就只能在CDS两端设计了，可以调整下两端引物长度来改变下Tm值GC含量，但是调整余地不大。
不过不必担心，PCR本身很容易做，仅用于扩增的话对引物要求很低的。你这种情况我们一般也不看软件，直接两端各取18~20bp就ok了。大胆做就是了哈~
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2012-01-20 12:57:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

鱼山听涛

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
西瓜(金币+1): 鼓励应助 2012-01-20 12:50:48
primer可以自行确定引物位置，把引物拖到CDS两端就可以了，然后看一下有没有二聚体和Tm就可以了。
赞一下(1人) 回复此楼
书到用时方恨少
2楼2012-01-20 09:24:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hyhl

铁杆木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 鱼山听涛 at 2012-01-20 09:24:48:
primer可以自行确定引物位置，把引物拖到CDS两端就可以了，然后看一下有没有二聚体和Tm就可以了。

同意2楼意见，请楼主再仔细摸索一下软件，可以设计全长引物啊！或者不用软件，你就自己选择一对，拿到软件里看下有没有二聚体、发夹结构什么的，及其Tm。
赞一下 回复此楼
4楼2012-01-20 10:32:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

7788945

银虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★
西瓜(金币+5): 鼓励交流~春节快乐哈~ 2012-01-26 12:29:07
引用回帖:
3楼: Originally posted by chenguestc at 2012-01-20 09:32:02:
参照楼上。
如果参照楼上设计引物不好用，就只有在CDS中间设计引物，获得序列后再用RACE获得全长。

已知CDS，就用不着RACE了，成本忒高
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2012-01-26 12:18:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bst5

银虫 (小有名气)
可以把你要扩增的序列往两端延长一段，然后把整个序列粘贴到primer5中，限定上下游引物的位置，就可以自动生成了，不同意楼上几位手动设计引物的观点，除非你模板是质粒，要是是cDNA的话，那样会有很多非特异扩增，费时又费力，祝好运！
赞一下 回复此楼
7楼2012-01-31 17:11:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小沫沫188

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by bst5 at 2012-01-31 17:11:18
可以把你要扩增的序列往两端延长一段，然后把整个序列粘贴到primer5中，限定上下游引物的位置，就可以自动生成了，不同意楼上几位手动设计引物的观点，除非你模板是质粒，要是是cDNA的话，那样会有很多非特异扩增， ...

请问怎么把序列往两端延长啊
赞一下 回复此楼
8楼2014-03-31 16:58:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卷卷有人用了

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 西瓜 at 2012-01-20 12:57:19
扩增CDS就只能在CDS两端设计了，可以调整下两端引物长度来改变下Tm值GC含量，但是调整余地不大。
不过不必担心，PCR本身很容易做，仅用于扩增的话对引物要求很低的。你这种情况我们一般也不看软件，直接两端各取18 ...

你好，请问我做染色体步移克隆启动子，我只能找到目的基因的CDS区，怎么设计引物啊。跪求
赞一下 回复此楼
9楼2016-03-02 10:25:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

爱笑的芳宝8

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 卷卷有人用了 at 2016-03-02 10:25:21
你好，请问我做染色体步移克隆启动子，我只能找到目的基因的CDS区，怎么设计引物啊。跪求...

同求……

发自小木虫Android客户端
回复此楼
10楼2017-02-22 05:21:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 btx362237729 的主题更新
111/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 298求调剂 +4 种圣赐 2026-03-28 4/200 2026-03-29 08:42 by q1092522407
[硕博家园] 招收生物学/细胞生物学调剂 +4 IceGuo 2026-03-26 5/250 2026-03-29 01:25 by griffith2014
[考研] 一志愿哈尔滨工业大学材料与化工方向336分 +9 辰沐5211314 2026-03-26 9/450 2026-03-29 01:12 by 我是小康
[考研] 数一英一271专硕（085401）求调剂，可跨 +7 前行必有光 2026-03-28 8/400 2026-03-28 23:22 by 小木虫tim
[考研] 295求调剂 +4 wei-5 2026-03-26 4/200 2026-03-28 23:20 by 小木虫tim
[考研] 本科新能源科学与工程，一志愿华理能动285求调剂 +7 AZMK 2026-03-28 11/550 2026-03-28 21:01 by xxxsssccc
[考研] 085600 286分 材料求调剂 +7 麻辣鱿鱼 2026-03-27 8/400 2026-03-28 12:17 by zllcz
[考研] 285求调剂 +4 AZMK 2026-03-27 7/350 2026-03-27 20:59 by AZMK
[考研] 265求调剂11408 +3 刘小鹿lu 2026-03-27 3/150 2026-03-27 20:53 by nihaoar
[考研] 308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-25 7/350 2026-03-27 14:47 by 狂炫麦当当
[考研] 0703化学338求调剂！ +6 Zuhui0306 2026-03-26 7/350 2026-03-27 10:35 by shangxh
[考研] 321求调剂 +6 wasdssaa 2026-03-26 6/300 2026-03-26 20:57 by sanrepian
[考研] 085601求调剂总分293英一数二 +4 钢铁大炮 2026-03-24 4/200 2026-03-26 16:28 by dick_runner
[考研] 一志愿 南京邮电大学 288分 材料考研 求调剂 +3 jl0720 2026-03-26 3/150 2026-03-26 13:39 by zzll406
[考研] 一志愿哈工大，085400，320，求调剂 +4 gdlf9999 2026-03-24 4/200 2026-03-25 23:01 by boxking200
[考研] 求调剂 +6 研研，接电话 2026-03-24 7/350 2026-03-24 17:01 by barlinike
[考研] 一志愿吉大化学322求调剂 +4 17501029541 2026-03-23 6/300 2026-03-24 10:21 by 戴围脖的小蚊子
[考研] 一志愿河北工业大学0817化工278分求调剂 +7 jhybd 2026-03-23 12/600 2026-03-24 09:03 by jhybd
[考研] 一志愿山东大学药学学硕求调剂 +3 开开心心没烦恼 2026-03-23 4/200 2026-03-24 00:06 by 开开心心没烦恼
[考研] 070300，一志愿北航320求调剂 +3 Jerry0216 2026-03-22 5/250 2026-03-23 09:16 by 。。堂堂
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭