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sunmoods

金虫 (小有名气)

[求助] 求分析PCR电泳图

细菌16SrDNA  V3区  带GC夹子PCR
94             50S
55             30S
72              30S
25循环
条带拖尾,不知道什么原因,怎么优化,求助

循环30次的时候 空白条带很明显



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叮叮0504

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

你们实验室一直用的是这个程序吗?我们做细菌的DGGE一般都是用TOUCHDOWN程序或者你可以选择做V6区,V6区引物特异性强于V3区。
7楼2011-12-07 08:52:28
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Icityman

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

wanhscn: 非应助回帖! 2011-12-06 14:54:21
我跑的图也是这样,我也想找原因,希望高手帮你解决把
2楼2011-12-06 10:01:09
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翰章

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


sunmoods(金币+2): 2011-12-07 10:36:10
西瓜(金币+1): 鼓励应助 2011-12-08 18:40:29
体系中加入一些BSA试试,电泳的时候最好是有marker对照
3楼2011-12-06 17:24:42
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翰章

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


sunmoods(金币+8): 1 2011-12-07 10:36:20
西瓜(金币+1): Good 2011-12-08 18:40:34
还有,94℃ 50S有点长,改为30S试试,因为V3区的目的片段大概是200左右吧
4楼2011-12-06 17:26:00
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