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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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xinji

主管区长

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！

[求助] Gromacs加入溶剂分子数目问题

请教各位，在一个box中，可以用genbox ****** -cs  ***** 加入溶剂，但是所加入的溶剂数目却无法确定，似乎是系统自定的 ，在进行模拟的时候，需要指定具体数目或具体密度吗？
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心若在，梦就在！
1楼 2011-11-21 17:16:57
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zhongyunxia

版主

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！

【答案】应助回帖

★ ★
xinji(金币+10): 2011-11-22 10:50:32
ghcacj(金币+2): 谢谢 2011-11-22 13:22:19
好像不需要确定溶剂分子的数目，只有加入药物的时候，需要指定分子的数目。
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2楼2011-11-21 20:09:36
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jawang

专家顾问

优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！优秀！！有木有！！！
引用回帖:
1楼: Originally posted by xinji at 2011-11-21 17:16:57:
请教各位，在一个box中，可以用genbox ****** -cs  ***** 加入溶剂，但是所加入的溶剂数目却无法确定，似乎是系统自定的 ，在进行模拟的时候，需要指定具体数目或具体密度吗？

如果你要模拟的是一般情况的，就用默认的就好了。
但是如果你要模拟特殊情况的，比如高盐浓度下的时候，可以使用-nmol来指定个数
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3楼2011-11-22 12:04:43
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