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tianhuijuan

金虫 (小有名气)


[交流] 碱裂解法提质粒之怪现象

如题,最近一直在做克隆,质粒提取经常出现同样的问题:同样的实验操作,之前有提取出来,最近几次都是失败,电泳检测无条带出现,其中有时会有RNase消化后浑浊,离心有不溶物的现象。用了鼎国质粒快速提取试剂盒提取,同样无结果,师姐说是不是实验室摇床出问题了... 虫友们帮忙支支招,谢谢啦~
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nnxqwei

至尊木虫 (职业作家)


★ ★
tianhuijuan(金币+10): 2011-09-26 18:24:12
adslye(金币+2): 鼓励交流~国庆快乐~ 2011-09-30 16:52:34
1.首先确定你培养的菌有没有问题,确定它还有质粒吗?
2.试剂盒各溶液确定没有问题吗?
3.操作过程有没有出问题?
2楼2011-09-26 18:01:36
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tianhuijuan

金虫 (小有名气)


引用回帖:
2楼: Originally posted by nnxqwei at 2011-09-26 18:01:36:
1.首先确定你培养的菌有没有问题,确定它还有质粒吗?
2.试剂盒各溶液确定没有问题吗?
3.操作过程有没有出问题?

首先谢谢你的意见。我培养的菌是实验室冻存的,没问题,之前提出来过,同时新转化了一批同样的质粒,提质粒也没结果,因该不是菌的问题;试剂盒也是先前用过的,可能会过期,但是与手提结果一样,估计也没问题吧;操作过程已经很是注意了,每一步都很小心的,实在想不出哪里的原因了..
3楼2011-09-26 18:23:58
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nnxqwei

至尊木虫 (职业作家)


★ ★
adslye(金币+2): 很热心~ 2011-09-30 16:53:06
1.质粒有多大,它的拷贝数大吗?它在宿主中稳定吗?
2.如果质粒在宿主是稳定存在,不可能提不出来吧。。。
3.“操作过程已经很是注意了,每一步都很小心的”如果你的洗液用久了,又没盖好的话,乙醇挥发了,是提不出质粒的。。。
4楼2011-09-26 18:47:41
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tianhuijuan

金虫 (小有名气)


引用回帖:
4楼: Originally posted by nnxqwei at 2011-09-26 18:47:41:
1.质粒有多大,它的拷贝数大吗?它在宿主中稳定吗?
2.如果质粒在宿主是稳定存在,不可能提不出来吧。。。
3.“操作过程已经很是注意了,每一步都很小心的”如果你的洗液用久了,又没盖好的话,乙醇挥发了,是提 ...

所用质粒是实验室里常用的pGEX-5x-1,大肠杆菌宿主细胞,这麽多年了就没出过问题的。碱裂解法提质粒所用的溶液1,3配了储存液,每次用的时候取适量高压灭菌的,溶液2、70%乙醇每次都现配,NaAc也是用-20度的储存液.你的意思不是配培养条件的影响?
5楼2011-09-26 18:56:55
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nnxqwei

至尊木虫 (职业作家)


以上你说的溶液和操作没问题的话,可能培养出问题,质粒不稳定存在了吧
6楼2011-09-26 19:08:01
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tianhuijuan

金虫 (小有名气)


引用回帖:
6楼: Originally posted by nnxqwei at 2011-09-26 19:08:01:
以上你说的溶液和操作没问题的话,可能培养出问题,质粒不稳定存在了吧

今天换个水浴摇床试一下,但愿能找到原因。多谢帮助。
7楼2011-09-26 19:24:51
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试剂盒应该没问题    可能还是手法上的事
8楼2011-09-27 09:52:54
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tianhuijuan

金虫 (小有名气)


引用回帖:
8楼: Originally posted by linyingjia at 2011-09-27 09:52:54:
试剂盒应该没问题    可能还是手法上的事

经典的几个步骤,之前提出来过的,再不行就换个人试一下。多谢版主。
9楼2011-09-27 10:34:17
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tianhuijuan

金虫 (小有名气)


后续试验证明:培养没问题;所有用到溶液重新配置提取出来了。不过还是纠结:储存液怎麽就不行了,在冰箱放置时间又不长,看来以后不能再嫌麻烦了。
10楼2011-09-28 14:26:02
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tdhslxiaoyao

新虫 (小有名气)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
有可能是菌体培养时间过长了,看看菌液是否有浑浊体。另外也跟操作技术不稳定有关,祝你好运
11楼2011-09-30 15:34:14
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adslye

银虫 (正式写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
A.花点时间设计阴阳性对照排除各种可能,比如:
1.找一个实验室别人的菌,肯定有质粒的。用现有试剂提一遍。排除:试剂和手法问题。
2.如果1中提出来了,说明是菌的问题。
  2.1还有没有保种的菌?有的话,拿来摇起来,提一下。
  2.2用别的保种的菌做阳性对照,与自己的菌一起摇,排除培养问题。
等等,做一个系统的规划,就不会乱了。

B.提质粒出问题,好久没见过了。没必要为这种实验浪费时间。
有个快捷方法:请隔壁实验室的MM吃顿饭,让她用她的试剂帮你提一遍。
如果提不出,基本确定是菌的问题了,估计还是很严重的问题。

祝好运,十一快乐。
12楼2011-09-30 17:04:51
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tianhuijuan

金虫 (小有名气)


引用回帖:
12楼: Originally posted by adslye at 2011-09-30 17:04:51:
A.花点时间设计阴阳性对照排除各种可能,比如:
1.找一个实验室别人的菌,肯定有质粒的。用现有试剂提一遍。排除:试剂和手法问题。
2.如果1中提出来了,说明是菌的问题。
  2.1还有没有保种的菌?有的话,拿来 ...

多谢版主高见!
也祝十一快乐哈!
13楼2011-09-30 18:53:08
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tianhuijuan

金虫 (小有名气)


引用回帖:
11楼: Originally posted by tdhslxiaoyao at 2011-09-30 15:34:14:
有可能是菌体培养时间过长了,看看菌液是否有浑浊体。另外也跟操作技术不稳定有关,祝你好运

培养时间关系不大吧,一般16小时以内,细菌应该不崩溃死亡导致质粒丢失的。操作技术确实是个问题,有待提高。
多谢帮助回帖。
14楼2011-09-30 18:58:19
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花花贝

金虫 (知名作家)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
我们用TAKARA或OMEGA试剂盒,屡试不爽。一般就是提取液的问题,建议试剂盒提取。

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15楼2011-10-03 19:21:07
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tianhuijuan

金虫 (小有名气)


送鲜花一朵
引用回帖:
15楼: Originally posted by 花花贝 at 2011-10-03 19:21:07:
我们用TAKARA或OMEGA试剂盒,屡试不爽。一般就是提取液的问题,建议试剂盒提取。

实验室一直有勤俭节约的优良作风与传统,手提费时,效果还行.呵呵
16楼2011-10-03 21:36:43
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WQS1991

银虫 (正式写手)


学习了
17楼2014-08-21 13:04:13
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