应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 求教DGGE相关的基本问题（做过的请指教）
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 1692  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

dovekaoyan

木虫 (正式写手)

[求助] 求教DGGE相关的基本问题（做过的请指教）

我要分析海洋中获得的微生物样品中微生物的种类，里面可能有细菌、真菌、藻类等，想先做DGGE，请问应用什么引物，细菌16S的通用引物？还是真菌的ITS通用引物？还是两者可以同时使用？“合成的引物最好在5‘端加上40个碱基左右的G-C串”这是什么意思，请举例说明一下什么是GC串？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-08-11 14:07:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangxianqin

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

dovekaoyan(金币+2): 谢谢 2011-08-17 09:21:06
引用回帖:
4楼: Originally posted by dovekaoyan at 2011-08-16 20:24:17:
一般引物都是二十几个bp,这里在5‘端就加40bp，感觉有点儿不可思议，请问这样没关系吗？

要是没有40bp，就不能跑DGGE了，就跟一般的没什么区别了。
GC夹（GC clamp）就是在一侧引物的5′端加上一个30~40bp的GC结构，这样在PCR产物的一侧可产生一个高熔点区，其他部分就处在低温解链区从而可以对其进分析。
赞一下 回复此楼
5楼2011-08-17 09:10:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

海绵控

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
1949stone(金币+1): 鼓励 2011-08-11 18:11:00
dovekaoyan(金币+1): 2011-08-12 09:27:40
我是做PCR的，如果你两种引物都用，那就是双重PCR了，而且，我没见过双重PCR与变性梯度凝胶电泳相结合的文献，不过挺可行的。GC串应该就是GC重复，这个还没做过
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-08-11 15:18:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangxianqin

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
西瓜(金币+1): 鼓励交流 2011-08-16 11:39:11
dovekaoyan(金币+3): 2011-08-16 20:24:29
GC就是一段含GC的重复序列，一般很多文章里面都有，看看文章就知道了。我们真菌和细菌是分开跑的，细菌跑的16s，真菌跑的ITS.
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-08-16 10:10:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dovekaoyan

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhangxianqin at 2011-08-16 10:10:42:
GC就是一段含GC的重复序列，一般很多文章里面都有，看看文章就知道了。我们真菌和细菌是分开跑的，细菌跑的16s，真菌跑的ITS.

一般引物都是二十几个bp,这里在5‘端就加40bp，感觉有点儿不可思议，请问这样没关系吗？
赞一下 回复此楼
4楼2011-08-16 20:24:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 机械学硕总分317求调剂！！！！ +5 Acaciad 2026-03-25 5/250 2026-03-31 12:04 by 北风之神.
[考研] 266分，求材料相关专业调剂 +10 哇呼哼呼哼 2026-03-30 12/600 2026-03-31 11:00 by 熊一刀
[考研] 材料专硕调剂 +12 椰椰。 2026-03-29 12/600 2026-03-31 10:52 by foria
[考研] 0817化工学硕调剂 +7 努力上岸中！ 2026-03-31 7/350 2026-03-31 09:58 by nalakaiqi
[考研] 一志愿 南京航空航天大学 ，080500材料科学与工程学硕 +5 @taotao 2026-03-30 5/250 2026-03-31 09:41 by zhshch
[考研] 335求调剂 +3 321* 2026-03-31 3/150 2026-03-31 09:00 by 功夫疯狂
[考研] 085601 329分调剂 +4 yzsa12 2026-03-31 4/200 2026-03-31 08:11 by jp9609
[考研] 一志愿郑大材料工程290求调剂 +12 Youth_ 2026-03-30 12/600 2026-03-31 03:34 by 蒙奇奇521
[考研] 英一数一408，总分284，二战真诚求调剂 +3 12.27 2026-03-30 5/250 2026-03-31 00:47 by 不吃芒果17
[考研] 286分调剂 +10 Faune 2026-03-30 11/550 2026-03-30 20:35 by 啊李999
[考研] 334分 一志愿武理 材料求调剂 +16 李李不服输 2026-03-26 16/800 2026-03-30 17:47 by wangjy2002
[考研] 298求调剂 +3 什么是胖头鱼 2026-03-30 5/250 2026-03-30 14:41 by 青海小西牛
[考研] 求调剂 +7 青春裁为三截 2026-03-29 7/350 2026-03-30 13:14 by laoshidan
[考研] 一志愿北京工业大学，324分求调剂 +6 零八# 2026-03-28 6/300 2026-03-29 21:20 by nanaliuyun
[考研] 总分293求调剂 +8 加一一九 2026-03-25 11/550 2026-03-29 19:53 by 无际的草原
[硕博家园] 招收生物学/细胞生物学调剂 +4 IceGuo 2026-03-26 5/250 2026-03-29 01:25 by griffith2014
[考研] 086502化学工程342求调剂 +6 阿姨复古不过 2026-03-27 6/300 2026-03-28 07:06 by wangy0907
[考研] 考研一志愿苏州大学初始315（英一）求调剂 +3 sbdksD 2026-03-24 4/200 2026-03-25 18:16 by xcjcqu
[考研] 296求调剂 +4 汪！？！ 2026-03-25 7/350 2026-03-25 16:41 by 汪！？！
[考研] 【2026考研调剂】制药工程 284分 求相关专业调剂名额 +4 袁奂奂 2026-03-25 8/400 2026-03-25 14:32 by lbsjt
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭