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huangk1199

木虫 (正式写手)

[求助] 悲催的DGGE结果,求教

细菌V3-V5区的DGGE,6 %的凝胶变形梯度为40%-70%,电压140V,电泳时间为10h,SYBR染色20min,效果咋就是这样的,我做了两次都是这样的
还有SYBR染色剂的配置是不是用1*TAE/SYBR=10000/1???


[ Last edited by huangk1199 on 2012-1-11 at 13:10 ]
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一路蚯蚓
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蘇二爱喝椰汁

新虫 (初入文坛)

DNA样品降解么?
2楼2012-01-11 16:57:59
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Rick001

铁杆木虫 (职业作家)

钓鱼岛环保首席秘书

分子生物学的东西都是经常遇到一些莫名其妙的问题,很是让人摸不到头脑。祝楼主早日找到问题所在。
☆☆☆想开了,便能走出去☆☆☆
3楼2012-01-12 10:37:48
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huangk1199

木虫 (正式写手)

引用回帖:
楼: Originally posted by 蘇二爱喝椰汁 at 2012-01-11 16:57:59:
DNA样品降解么?

有这种可能,我是PCR后放到-20度冰箱保存12小时后做的DGGE
一路蚯蚓
4楼2012-01-12 10:53:05
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huangk1199

木虫 (正式写手)

引用回帖:
楼: Originally posted by Rick001 at 2012-01-12 10:37:48:
分子生物学的东西都是经常遇到一些莫名其妙的问题,很是让人摸不到头脑。祝楼主早日找到问题所在。

谢谢啊,我准备用DGGE-maker 标记一下,看结果,找原因
一路蚯蚓
5楼2012-01-12 10:54:33
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怎么都行

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
huangk1199(金币+2): ★有帮助 2012-01-12 21:26:31
强烈建议楼主用银染。用花青类染料染PAGE胶一则灵敏度低,量少的条带几乎看不到,影响结果判断,二则容易出现LZ所遇到的弥散状态。
6楼2012-01-12 18:13:05
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feng811129

木虫 (小有名气)

PCR产物的问题
7楼2012-01-14 14:06:07
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hnp860802

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
huangk1199(金币+5): ★★★很有帮助 2012-01-17 11:58:17
问题可能出在pcr和做胶两部分
8楼2012-01-16 23:17:16
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huangk1199

木虫 (正式写手)

冲着年初一的喜气,我DGGE跑出来了,哈哈
新年快乐
一路蚯蚓
9楼2012-01-25 09:07:26
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germ2010

木虫 (正式写手)

Sustainability

跑出来就好,这东西比较麻烦!不过感觉你电压有点高,电压小一点会更好看,我一般用100v,10h
问问楼主有DGGE胶分析的软件吗?
路虽遥行则必至!事虽难做则有成!努力奋斗!
10楼2012-02-07 10:31:42
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