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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 关于DGGE的应用
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lihongyeer

金虫 (正式写手)

[求助] 关于DGGE的应用

大家好， 想请教你一个DGGE的问题，利用DGGE能反映介质中微生物种类的变化吗？条带亮度能不能定量反映这种变化？谢谢了！！另外，我将分离到的微生物加到一种天然介质，比如水中，想表达这种外源微生物与水中土著微生物的消长，是不是就可以用dgge，这里外源微生物是确定到属的，DGGE能不能反映该微生物与其他土著微生物的竞争？

多谢大家！！
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Strivetomakeeverydayjoyfulandmeaningful！
1楼 2011-06-29 16:46:34
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xiadongliang

金虫 (正式写手)
★ ★
rainwander(金币+2): 代楼主发 2011-06-30 15:04:50
引用回帖:
Originally posted by lihongyeer at 2011-06-29 16:46:34:
大家好， 想请教你一个DGGE的问题，利用DGGE能反映介质中微生物种类的变化吗？条带亮度能不能定量反映这种变化？谢谢了！！另外，我将分离到的微生物加到一种天然介质，比如水中，想表达这种外源微生物与水中土著 ...

可以，可以。
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2楼2011-06-30 14:39:15
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lihongyeer

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by xiadongliang at 2011-06-30 14:39:15:
可以，可以。

谢谢，一些朋友说无法定量，有道理
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Strivetomakeeverydayjoyfulandmeaningful！
3楼2011-06-30 14:43:30
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张俊亚

木虫 (正式写手)
★
rainwander(金币+1): 鼓励交流 2011-07-03 16:54:13
恩 DGGE无法定量,并且有时由于PCR以及DGGE本身的原因,会导致一些弱势群体微生物检测不到!
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4楼2011-07-02 22:02:56
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lihongyeer

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 张俊亚 at 2011-07-02 22:02:56:
恩 DGGE无法定量,并且有时由于PCR以及DGGE本身的原因,会导致一些弱势群体微生物检测不到!

恩，多谢你的提醒
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Strivetomakeeverydayjoyfulandmeaningful！
5楼2011-07-02 22:47:34
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小小木虫8580

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

lihongyeer(金币+2): 2011-07-03 10:16:34
能不能定量要看自己的技术，不过这里所说的可以定量也只是相对的定量。
如果要做到定量的话需要控制好很多因素，比如模板浓度一致、DNA提取条件一致等。即使如此，DGGE的定量还是会遭受审稿人的尖锐批评，除非你有其他的指标可以佐证你的DGGE结果。既然要定量，那还是做real time 吧！
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6楼2011-07-03 10:04:11
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xiadongliang

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 小小木虫8580 at 2011-07-03 10:04:11:
能不能定量要看自己的技术，不过这里所说的可以定量也只是相对的定量。
如果要做到定量的话需要控制好很多因素，比如模板浓度一致、DNA提取条件一致等。即使如此，DGGE的定量还是会遭受审稿人的尖锐批评，除非你 ...

real time 做细菌定量的也比较多，你可以考虑这个方法。
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7楼2011-07-04 14:15:35
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