应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 【求助/交流】土壤采样及DGGE问题
151/2返回列表12下一页
查看: 1895  |  回复: 14
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
【有奖交流】积极回复本帖子，参与交流，就有机会分得作者 annwt 的 1 个金币 ，回帖就立即获得 1 个金币，每人有 1 次机会

annwt

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】土壤采样及DGGE问题

如果土壤采样为提取DNA 去做DGGE分析，应注意那些问题，
DGGE设备好操作吗？有做过的给点建议!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼2010-10-28 22:10:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献
★
annwt(金币+1):谢谢参与
annwt(金币+1): 2010-10-29 20:45:10
呵呵，土壤DNA的提取纯化是关键。后面的DGGE刚跑的时候最好有个人带你做一次，否则你还是要跑几次练手的。
赞一下(1人) 回复此楼
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
2楼2010-10-28 22:12:04
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiadongliang

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
annwt(金币+1):谢谢参与
annwt(金币+1): 2010-10-29 20:45:15
scelab(金币+2):热心虫友，欢迎多来交流~~~:tiger06::tiger28::tiger23: 2010-10-31 00:12:29
采样本身问题不大，从几个点采样后混合在一起，尽量保证土壤中细菌丰度就好了。DNA提取自己配试剂提取就可以了。
DGGE电泳中PCR产物一定好扩增的好才能保证。
赞一下(2人) 回复此楼
3楼2010-10-29 08:57:10
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

在雨中

金虫 (著名写手)
★
annwt(金币+1):谢谢参与
annwt(金币+1): 2010-10-29 20:45:19
我觉得,DGGE没有做过的话,具体操作是个坎,很有可能,你要重复操作很多次能才熟悉,得出漂亮的图来
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2010-10-29 12:38:30
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tsq0126

金虫 (小有名气)
★ ★
annwt(金币+1):谢谢参与
annwt(金币+1): 2010-10-29 20:45:36
scelab(金币+1):欢迎多来交流！:tiger06: 2010-10-31 00:12:22
二楼的兄弟，你提取土壤的DNA含量大概有多少，我的每克土壤中只能提取4ug左右，用提取的dna稀释10倍进行pcr,条带不单一，有非特异性扩增。
赞一下(2人) 回复此楼
5楼2010-10-29 14:51:28
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tsq0126

金虫 (小有名气)
哪位兄弟有过类似的问题，如果有好的方法解决，兄弟感激涕零。
赞一下 回复此楼
6楼2010-10-29 14:52:35
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雪剑57689

银虫 (小有名气)
★ ★ ★
annwt(金币+1):谢谢参与
scelab(金币+2):鼓励新虫！欢迎多来交流！:tiger06: 2010-10-31 00:12:06
annwt(金币+2): 2010-10-31 16:27:29
这个你得重复很多次的  才能出好的结果  个人感觉重复性不是很好  再就是引物问题  得要找一个很保守的引物~~~
赞一下(2人) 回复此楼
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
7楼2010-10-30 21:23:31
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiadongliang

金虫 (正式写手)
annwt(金币+2): 2010-10-31 19:03:26
引用回帖:
Originally posted by tsq0126 at 2010-10-29 14:51:28:
二楼的兄弟，你提取土壤的DNA含量大概有多少，我的每克土壤中只能提取4ug左右，用提取的dna稀释10倍进行pcr,条带不单一，有非特异性扩增。

能提取到4ugDNA，DNA的量已经很高了。足以进行下游实验了。
非特异扩增应该不会吧。16S rDNA的通用引物不应该存在非特异扩增啊。
看你的电泳图，应该不是非特异的条带，最下面的是引物二聚体。

[ Last edited by xiadongliang on 2010-10-31 at 17:37 ]
赞一下 回复此楼
8楼2010-10-31 17:35:37
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tsq0126

金虫 (小有名气)
★
dhd997(金币+1):鼓励交流。 2010-11-01 18:45:54
annwt(金币+2): 2010-11-02 07:33:18
我现在不确定特异性条带上面拖的是什么东西？最亮的地方就是我的特异性条带，大概250bp,和marker吻合，我做的是嵌套PCR，先扩增16S rDNA全长，大概1600bp，再利用1P产物作为模板，进行V3片段的扩增，对1P产物也做过纯化，扩增的效果和上图一样，不知道是什么原因，哪位大侠帮帮忙，给点建议。
赞一下(1人) 回复此楼
9楼2010-11-01 18:42:39
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tdong06

木虫 (正式写手)
★
annwt(金币+1):谢谢参与
annwt(金币+2): 2010-11-03 22:26:25
提高下退火温度试试看。
赞一下(1人) 回复此楼
10楼2010-11-03 14:31:03
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 annwt 的主题更新
151/2返回列表12下一页
提示: 如果您在30分钟内回复过其他散金贴，则可能无法领取此贴金币
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复(可上传附件) 论文翻译-EnPapers美助理教授团队-SCI英文润色
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 我标书代码变了 +51 学员NHuqdk 2024-06-16 68/3400 2024-06-18 13:21 by 好奇宝宝妞
[找工作] 药学硕士找不到工作，打算去做科研助理了 +6 pom戴墨镜 2024-06-14 19/950 2024-06-18 13:06 by lialee22
[论文投稿] 投稿求助 10+3 2022_灵魂工程师 2024-06-16 8/400 2024-06-18 12:12 by 投必得科研顾问
[论文投稿] 最近写了一篇控制优化领域的文章，可以投哪里啊？有没有水一些的期刊推荐 +8 香瓜木香 2024-06-12 14/700 2024-06-18 11:16 by 晓目崇
[高分子] 烧瓶内合成聚酯 +3 大帝国乐 2024-06-17 7/350 2024-06-18 11:10 by 大帝国乐
[硕博家园] 豫北虫友互识 +4 xuhongli903 2024-06-18 4/200 2024-06-18 10:26 by 飘逸的丁香
[基金申请] 2024国社科通讯评审 +14 qsd10086 2024-06-13 28/1400 2024-06-18 10:13 by 求易
[精细化工] 试剂价格 +3 旭必上岸 2024-06-17 3/150 2024-06-18 09:13 by kzx_33
[硕博家园] 博士毕业高校和就业的相关问题 +7 SCITOPPP 2024-06-14 11/550 2024-06-18 07:51 by yinxing1995
[论文投稿] 论文已接收，但发现修改稿传的是旧版该怎么办？ +3 zsq54321 2024-06-15 6/300 2024-06-17 19:45 by wjykycg
[催化] 镍负载氧化铝的保存问题 8+3 lwn0130 2024-06-15 4/200 2024-06-17 10:48 by adaihao
[教师之家] 每次骚扰女学生的都是院系领导，而不是普通教师，小编们要注意措辞正确 +9 zju2000 2024-06-15 11/550 2024-06-16 14:49 by appleapple2
[基金申请] 希望今年自己国自然面上项目和老婆青年项目能中！ +7 恐龙爸爸 2024-06-14 7/350 2024-06-16 14:48 by redfish105
[基金申请] 博士后基金需要结题吗？ +8 zhouchuck 2024-06-13 8/400 2024-06-14 17:27 by liuyupu132
[基金申请] 工材E口JQ有消息了吗 +4 babyduck 2024-06-11 4/200 2024-06-14 17:23 by firepick
[基金申请] E12面上申请 +4 汉风之遗 2024-06-13 4/200 2024-06-14 15:28 by 天外飞去来
[基金申请] 75批博后基金 +10 kyukitu 2024-06-13 13/650 2024-06-14 10:31 by kyukitu
[硕博家园] 机械研究生如何拿到年薪40+w +13 阿巴阿巴哦哦 2024-06-11 15/750 2024-06-13 15:40 by 113745685
[有机交流] 原料反应完了，怎么知道是产物还是中间体 +6 小胡在努力 2024-06-11 8/400 2024-06-13 13:33 by 091602
[论文投稿] with editor日期变更 +3 慎独的小花卷 2024-06-12 8/400 2024-06-13 11:00 by 慎独的小花卷
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭