应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 求教DGGE相关的基本问题（做过的请指教）
51/1返回列表
查看: 1665  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

dovekaoyan

木虫 (正式写手)

[求助] 求教DGGE相关的基本问题（做过的请指教）

我要分析海洋中获得的微生物样品中微生物的种类，里面可能有细菌、真菌、藻类等，想先做DGGE，请问应用什么引物，细菌16S的通用引物？还是真菌的ITS通用引物？还是两者可以同时使用？“合成的引物最好在5‘端加上40个碱基左右的G-C串”这是什么意思，请举例说明一下什么是GC串？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-08-11 14:07:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangxianqin

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
西瓜(金币+1): 鼓励交流 2011-08-16 11:39:11
dovekaoyan(金币+3): 2011-08-16 20:24:29
GC就是一段含GC的重复序列，一般很多文章里面都有，看看文章就知道了。我们真菌和细菌是分开跑的，细菌跑的16s，真菌跑的ITS.
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2011-08-16 10:10:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

海绵控

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
1949stone(金币+1): 鼓励 2011-08-11 18:11:00
dovekaoyan(金币+1): 2011-08-12 09:27:40
我是做PCR的，如果你两种引物都用，那就是双重PCR了，而且，我没见过双重PCR与变性梯度凝胶电泳相结合的文献，不过挺可行的。GC串应该就是GC重复，这个还没做过
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-08-11 15:18:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dovekaoyan

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhangxianqin at 2011-08-16 10:10:42:
GC就是一段含GC的重复序列，一般很多文章里面都有，看看文章就知道了。我们真菌和细菌是分开跑的，细菌跑的16s，真菌跑的ITS.

一般引物都是二十几个bp,这里在5‘端就加40bp，感觉有点儿不可思议，请问这样没关系吗？
赞一下 回复此楼
4楼2011-08-16 20:24:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangxianqin

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

dovekaoyan(金币+2): 谢谢 2011-08-17 09:21:06
引用回帖:
4楼: Originally posted by dovekaoyan at 2011-08-16 20:24:17:
一般引物都是二十几个bp,这里在5‘端就加40bp，感觉有点儿不可思议，请问这样没关系吗？

要是没有40bp，就不能跑DGGE了，就跟一般的没什么区别了。
GC夹（GC clamp）就是在一侧引物的5′端加上一个30~40bp的GC结构，这样在PCR产物的一侧可产生一个高熔点区，其他部分就处在低温解链区从而可以对其进分析。
赞一下 回复此楼
5楼2011-08-17 09:10:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 303求调剂 +4 睿08 2026-03-17 6/300 2026-03-18 11:01 by Iveryant
[考研] 312求调剂 +7 陌宸希 2026-03-16 8/400 2026-03-18 09:54 by macy2011
[考研] 302求调剂 +9 呼呼呼。。。。 2026-03-17 9/450 2026-03-18 09:34 by zhukairuo
[教师之家] 焦虑 +8 水冰月月野兔 2026-03-13 10/500 2026-03-18 09:21 by 咪呜喵呜
[考研] 265求调剂 +3 梁梁校校 2026-03-17 3/150 2026-03-18 09:12 by zhukairuo
[考研] 材料专硕306英一数二 +9 z1z2z3879 2026-03-16 12/600 2026-03-18 08:53 by zhukairuo
[考研] 278求调剂 +5 烟火先于春 2026-03-17 5/250 2026-03-18 08:43 by 星空星月
[考研] 281求调剂（0805） +3 烟汐忆海 2026-03-16 9/450 2026-03-18 07:23 by 烟汐忆海
[考研] 085601求调剂 +4 Du.11 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:08 by ruiyingmiao
[考研] 【0856】化学工程（085602）313 分，本科学科评估A类院校化学工程与工艺，诚求调剂 +7 小刘快快上岸 2026-03-11 8/400 2026-03-17 16:57 by ruiyingmiao
[考研] 材料与化工专硕调剂 +5 heming3743 2026-03-16 5/250 2026-03-17 14:03 by 勇敢太监王公公
[考研] 0854可跨调剂，一作一项核心论文五项专利，省、国级证书40+数一英一287 +3 小李0854 2026-03-16 3/150 2026-03-17 13:40 by 热情沙漠
[考研] 283求调剂 +10 小楼。 2026-03-12 14/700 2026-03-16 16:08 by 13811244083
[考研] 材料与化工 323 英一+数二+物化，一志愿：哈工大 本人本科双一流 +4 自由的_飞翔 2026-03-13 5/250 2026-03-14 19:39 by hmn_wj
[考研] 297一志愿上交085600求调剂 +5 指尖八千里 2026-03-14 5/250 2026-03-14 17:26 by a不易
[考研] 复试调剂 +3 呼呼？~+123456 2026-03-14 3/150 2026-03-14 16:53 by WTUChen
[考研] 学硕285求调剂 +13 Wisjxn 2026-03-12 46/2300 2026-03-14 10:33 by JourneyLucky
[考研] 求材料调剂 085600英一数二总分302 前三科235 精通机器学习 一志愿哈工大 +4 林yaxin 2026-03-12 4/200 2026-03-13 22:04 by 星空星月
[考研] 314求调剂 +7 无懈可击的巨人 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:40 by JourneyLucky
[考研] 一志愿山大07化学 332分 四六级已过 本科山东双非 求调剂！ +3 不想理你 2026-03-12 3/150 2026-03-13 14:18 by JourneyLucky
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭