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【求助】Amber中的MM-PBSA计算
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我的体系是一个带电荷的体系，MD时要加入补偿离子。 在做MM-PBSA之前要先把溶剂水去掉，补偿离子是不是保留？ 如果不保留的话，对于这个带电荷体系，应该怎么设置计算的参数呢？ 我看Amber手册上的那个例子是中性体系，对于带电荷的体系应该怎么处理？ |
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