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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 计算neb出错，请高手帮忙看看
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jixiao0526

金虫 (小有名气)

[求助] 计算neb出错，请高手帮忙看看

Error reading item 'IMAGES' from file INCAR.
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1楼 2012-05-01 16:29:30
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jixiao0526

金虫 (小有名气)
这是任务提交文件

#!/bin/bash
#PBS -N 2-O
#PBS -o vasp.out
#PBS -e vasp.err
#PBS -q dftsoft
#PBS -l nodes=2:ppn=8
np=`wc -l <$PBS_NODEFILE`
cat  $PBS_NODEFILE
/home/dftsoft/vasp_build/mpich2-1.3.1/bin/mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $np  /home/dftsoft/vasp_build/vasp.5.2/vasp_gobals_ifort
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2楼2012-05-01 16:36:38
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likai0106

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
WDD880227: 金币+2, 感谢您的细心解答 2012-05-02 18:39:01
引用回帖:
2楼: Originally posted by jixiao0526 at 2012-05-01 16:36:38:
这是任务提交文件

#!/bin/bash
#PBS -N 2-O
#PBS -o vasp.out
#PBS -e vasp.err
#PBS -q dftsoft
#PBS -l nodes=2:ppn=8
np=`wc -l <$PBS_NODEFILE`
cat  $PBS_NODEFILE
/home/dftsoft/vasp_build/ ...

两个问题，第一你的INCAR不存在
          第二你在INCAR中没有设置IMAGES=这个值
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3楼2012-05-02 09:40:32
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jixiao0526

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by likai0106 at 2012-05-02 09:40:32:
两个问题，第一你的INCAR不存在
          第二你在INCAR中没有设置IMAGES=这个值

两个问题都不是…
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4楼2012-05-02 10:25:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

likai0106

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
WDD880227: 金币+1, 感谢交流提示 2012-05-02 18:39:29
引用回帖:
4楼: Originally posted by jixiao0526 at 2012-05-02 10:25:45:
两个问题都不是…

把你的INCAR拿上来，再一个检查你INCAR的权限，是不是权限太高执行不了。试试把INCAR权限调低些
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5楼2012-05-02 10:50:55
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亚楠

至尊木虫 (知名作家)

追逐幸福的人

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
WDD880227: 金币+1, 感谢交流提示 2012-05-02 18:39:44
IMAGES=这个值设置有误，建议再看一下先关VASP资料。
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我的人生注定了有你陪伴，我们的生活会越来越美好，加油！
6楼2012-05-02 15:58:07
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亚楠

至尊木虫 (知名作家)

追逐幸福的人

【答案】应助回帖

★
liliangfang: 金币+1, 谢谢交流 2012-05-04 08:49:52
对了，应该是INCAR中设置插点的个数有问题，和实际产生的文件数不一致，要么就是你的核心数不能平均到每个插点上，比如，8个核的如果插点数为3的话就会出问题。
赞一下 回复此楼
我的人生注定了有你陪伴，我们的生活会越来越美好，加油！
7楼2012-05-02 16:01:26
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jixiao0526

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by likai0106 at 2012-05-02 10:50:55:
把你的INCAR拿上来，再一个检查你INCAR的权限，是不是权限太高执行不了。试试把INCAR权限调低些

怎么看incar的权限，怎么调整？
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8楼2012-05-02 17:51:29
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jixiao0526

金虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 亚楠 at 2012-05-02 15:58:07:
IMAGES=这个值设置有误，建议再看一下先关VASP资料。

我设置的是8啊，用的八个节点。8N不是吗？
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9楼2012-05-02 17:52:19
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jixiao0526

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 亚楠 at 2012-05-02 16:01:26:
对了，应该是INCAR中设置插点的个数有问题，和实际产生的文件数不一致，要么就是你的核心数不能平均到每个插点上，比如，8个核的如果插点数为3的话就会出问题。

我用的是8个节点，每个节点4核
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10楼2012-05-02 17:53:01
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