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【求助/交流】引物Tm值很高,PCR求助
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ikaren2013
金虫
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帖子: 143
在线: 102.1小时
虫号: 786738
[交流]
【求助/交流】引物Tm值很高,PCR求助
由于要做点突变,且突变位置很特殊很特殊,(考虑到突变位置,引物3'端配对长度),所以只能针对突变点限定性地设计了几对引物。 软件给出的Tm值相当高。相对于以下的结果图
第一对引物 Tm
第二对引物 Tm
第三对引物 Tm
第四对引物 Tm
摸条件四次结果,都非常不好,(也用过热启动,什么都没P出来,只有引物二聚体),急求解决方法.目的片段大小约为700bp
下图能看到每个体系都有十分微弱的目的条带
下图中的1,2,3为两点温度法
[
Last edited by ikaren2013 on 2011-1-14 at 11:36
]
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★ ★
最爱花诗雨(金币+2):热心的虫虫~~ 2011-01-14 09:08:07
强烈建议LZ换pfu酶,fermentals的不错价格也便宜。我做突变没出过问题。Tm这些应该没问题,PCR要求没这么严格。关键是酶,KOD太矫情了。
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3楼
2011-01-14 06:53:21
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楼主你突变用什么方法,Tm虽然高 但是跟模板结合的引物部分应该不是整个你的引物吧。
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7楼
2011-01-14 11:24:04
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Originally posted by
ikaren2013
at 2011-01-14 11:33:08:
我用普通PCR拉目的片段。我的突变位置很特殊,位于目的片段的起始部分。不能用重叠PCR来做此突变。
我的引物长度39bp中,含有酶切位点和三个保护性碱基。(即使除去这些,剩下的31bp,Tm值依然很高。)剩下的3 ...
楼主如果只有一两个碱基突变 为什么不设计一对互补引物,其中突变点位于中间 突变点两端各有15~20bp pfu直接PCR获得nicked plasmid 再DPn1 消化模板
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13楼
2011-01-15 22:05:27
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