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鹏飞九万里

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】pcr条带问题 已有9人参与

我以基因组为模板pcr四个基因,分别大小为800,1200,2700,4800,可是p出来的都是750bp左右,不知道是什么原因,请大家帮忙指导下,谢谢!
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waiwaidou_1983

铜虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
rainwander(金币+3):负对照很重要啊~~鼓励积极参与交流~~~ 2011-01-11 21:35:14
1 首先排除,负对照没有污染
2楼2011-01-11 20:13:26
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天使托

专家顾问 (职业作家)

T.Shen

是不是引物污染了?
有没有重复呢?
Whenever,Wherever,Anyway!MustRemember:Fight!KeepFighting!NeverGiveUp!
3楼2011-01-11 20:38:04
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luzeyan

金虫 (小有名气)

杂带

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 天使托 at 2011-01-11 20:38:04:
是不是引物污染了?
有没有重复呢?

有可能合成的杂带比较强
4楼2011-01-11 21:46:45
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jerry110

新虫 (小有名气)

应该是杂带吧
5楼2011-01-11 22:00:24
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funny8125

银虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
silicare(金币+1):不排除这个可能 2011-01-12 11:54:12
我也遇到过这种情况,我们扩出来的条带也是比目的条带小一点,然后回收测序后发现是引物会优先扩增这个片段,不是我们需要的目的片段,你可以去测序试试,看是不是引物的问题。
人类一思考,上帝就发笑。
6楼2011-01-12 11:36:57
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qumingnan

木虫 (正式写手)

取名难

★ ★
silicare(金币+2):两条都有道理 2011-01-12 11:53:53
第一个原因是引物被污染了,第二个原因是基因本身有问题
进取,进取,进取
7楼2011-01-12 11:44:16
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鹏飞九万里

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by qumingnan at 2011-01-12 11:44:16:
第一个原因是引物被污染了,第二个原因是基因本身有问题

引物是刚合成的,我现在正在排除是不是模板问题。。。谢了~~~
8楼2011-01-12 16:15:27
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鹏飞九万里

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by funny8125 at 2011-01-12 11:36:57:
我也遇到过这种情况,我们扩出来的条带也是比目的条带小一点,然后回收测序后发现是引物会优先扩增这个片段,不是我们需要的目的片段,你可以去测序试试,看是不是引物的问题。

好,先排除是不是基因组问题,再排除引物,引物是刚刚合成的。。。谢了
9楼2011-01-12 16:16:20
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鹏飞九万里

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
Originally posted by 天使托 at 2011-01-11 20:38:04:
是不是引物污染了?
有没有重复呢?

重复了。。。还是这样。。。引物是刚合成的,不可能被污染的。。。谢了~~
10楼2011-01-12 16:16:59
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