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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 【求助/交流】做DGGE，直接用带夹引物扩增不出来，怎么办？
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xuyong1228

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】做DGGE，直接用带夹引物扩增不出来，怎么办？已有7人参与

最近在做氨氧化细菌和古菌的试验，用稀释10倍的模板扩增（带夹）不出来，请问有人用不带夹的产物扩增带夹产物的吗?
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1楼2011-01-02 10:28:18
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ctt1984

木虫 (正式写手)

初学者
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
先用不带夹子的扩，再用不带夹子的扩，可能扩出来，但是不可取。因为DGGE是做微生物多样性的，你这样一来，人为造成了其不准确性！
慢慢摸条件吧，因为土壤里面腐殖质等很多，造成PCR效果不好，可以尝试用天根生产的MIX来做，我试过，自己混的有时候扩不出来，但这个很少出意外，就是价格黑了点。
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好好做事，踏实做人！
10楼2011-02-15 17:57:08
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在雨中

金虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
dhd997(金币+6):谢谢交流，补加参与奖励。 2011-01-02 13:13:49
我用不带夹子的引物扩增的很好呀。带上夹子效果一样。
是不是你的模板有问题，或者夹子设计不好？
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2楼2011-01-02 11:07:02
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xuyong1228

木虫 (小有名气)
★
dhd997(金币+1):谢谢交流 2011-01-02 13:14:01
我的模板是土壤DNA，不带夹的能扩增出来，带夹就不行，请问楼上的你是什么样品，带什么夹？
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3楼2011-01-02 11:14:13
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在雨中

金虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by xuyong1228 at 2011-01-02 11:14:13:
我的模板是土壤DNA，不带夹的能扩增出来，带夹就不行，请问楼上的你是什么样品，带什么夹？

我的也是土壤样品。我真的怀疑你的模板稀释后效果差了。。
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2011-01-02 13:24:04
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