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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » 【求助/交流】测序小问
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p120933799

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】测序小问

做了PCR产物进行了测序，之后拿到测序结果后在DNAMAN中与想要菌株的18s进行了比对，比对结果显示相似率达到85%，请问由此数据可否确定我所测菌株的种属问题？（本人做形态学鉴定观察后结果与我想要菌株是一个类型）
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1楼 2010-11-26 14:56:58
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skkyy88888

铜虫 (著名写手)
p120933799(金币+1): 2010-11-26 20:16:44
18S相似率达到85%那应该不是一个种的。
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2楼2010-11-26 18:24:43
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)
p120933799(金币+1): 2010-11-26 20:16:48
相似率85%其实同源性很差的，应该不是一个种的。
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3楼2010-11-26 18:36:42
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wmqouc

金虫 (著名写手)
p120933799(金币+1): 2010-11-26 20:16:52
85%较低，至少在98%之上
肯定不是一个种
建议重新PCR重新测
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4楼2010-11-26 19:19:19
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p120933799

金虫 (小有名气)

哦，

那我可以确定属了吧？
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5楼2010-11-26 20:16:26
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minfeng0608

新虫 (初入文坛)
p120933799(金币+1): 2010-11-27 09:27:57
也许可以再结合单酶切或者多酶切AFLP分析，效果较好。
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6楼2010-11-26 22:40:06
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kkunny

铜虫 (著名写手)
85%相似性太低了
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7楼2010-12-02 23:14:35
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段家一凡

木虫 (正式写手)
p120933799(金币+1): 2010-12-03 10:46:51
引用回帖:
Originally posted by p120933799 at 2010-11-26 20:16:26:
那我可以确定属了吧？

可能是测序的问题，或是序列分析的问题，你应该找一个序列分析高手请教一下，最有可能的是你将两端多余测出来的序列没有去掉。
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8楼2010-12-03 01:11:43
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