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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】PCR产物测序小问
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p120933799

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】PCR产物测序小问

刚接触菌种基因鉴定，送PCR产物进行测序，测序结果也出来了，请问在NCBI进行BLAST比对前是否要把测序结果处理下再比对，我是用的DNAman，请问怎么处理啊？越详细越好，在此多谢了
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1楼 2010-11-23 10:45:44
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fykxy_206

木虫 (正式写手)
p120933799(金币+1): 2010-11-23 22:16:54
不需要什么处理 直接将序列放入BLAST中就可以比对了
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2楼2010-11-23 10:53:23
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littlehong

木虫 (初入文坛)
直接把测序结果放进NCBI blast，就可以分析出来
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3楼2010-11-23 12:14:54
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p120933799

金虫 (小有名气)

可是

我是直接把测序结果NCBI中BLAST比对了，可是比对结果和我形态学鉴定结果根本不是那么一回事，即从形态学分析是我想要的，在BLAST比对不是我想要的。我PCR引物是ITS1和4，
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4楼2010-11-23 13:25:06
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wwllkkhh

金虫 (小有名气)
p120933799(金币+2): 2010-11-23 22:16:33
分子技术只是物种鉴定的辅助手段，不能作为绝对的判断依据。现在基本上还是以形态学为主，分子技术为辅。ITS结果与形态学结果差异大的情况经常出现。
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5楼2010-11-23 14:42:03
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