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p120933799

金虫 (小有名气)

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[交流] 【求助/交流】PCR产物测序小问

刚接触菌种基因鉴定，送PCR产物进行测序，测序结果也出来了，请问在NCBI进行BLAST比对前是否要把测序结果处理下再比对，我是用的DNAman，请问怎么处理啊？越详细越好，在此多谢了

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1楼 2010-11-23 10:45:44

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fykxy_206

木虫 (正式写手)

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p120933799(金币+1): 2010-11-23 22:16:54

不需要什么处理直接将序列放入BLAST中就可以比对了

2楼2010-11-23 10:53:23

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littlehong

木虫 (初入文坛)

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直接把测序结果放进NCBI blast，就可以分析出来

3楼2010-11-23 12:14:54

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p120933799

金虫 (小有名气)

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可是

我是直接把测序结果NCBI中BLAST比对了，可是比对结果和我形态学鉴定结果根本不是那么一回事，即从形态学分析是我想要的，在BLAST比对不是我想要的。我PCR引物是ITS1和4，

4楼2010-11-23 13:25:06

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wwllkkhh

金虫 (小有名气)

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p120933799(金币+2): 2010-11-23 22:16:33

分子技术只是物种鉴定的辅助手段，不能作为绝对的判断依据。现在基本上还是以形态学为主，分子技术为辅。ITS结果与形态学结果差异大的情况经常出现。

5楼2010-11-23 14:42:03

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