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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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kakaqa

铜虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】有关克隆方面的问题 已有4人参与

本人在做两个基因的克隆,使用Takara的EXtaq扩增出了DNA全长,分别为1800bp和3000bp左右,使用pMD18-T载体做T-A克隆。   
   1800bp左右的菌液PCR得到了和我目的条带一致的条带,送样测序结果找不到引物,经过BLAST比对后发现根本不是我要的目的条带,很困惑,为什么测序的结果找不到引物呢,是不是因为没连接上。或者是我根本就没扩出目的条带?可是测序结果总要找到引物啊。我的连接体系是1μl载体,4μlDNA, 5μl SoulutionⅠ,16℃连接了1天,按道理来说1800bp左右的片段连接过夜就可以了,为什么1天了也连接不上啊。
   另外想问一下3000bp的片段takara的载体不是很好连啊,我都做了2次了,都是没有结果,郁闷死了,哪位高手能提供点意见啊。
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yanliruqun

新虫 (初入文坛)

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scelab(金币+1):热心虫友,欢迎多来交流~~~:tiger06::tiger28::tiger23: 2010-11-03 23:34:26
Takara 的pMD18-T
适合于连1000以下的片段,2000以上的很难连,建议用KS2载体
2楼2010-11-03 23:27:13
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sai00fuji

金虫 (正式写手)


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我有个疑问,如果没有扩出目的条带为什么会P出和你目的条带一致的条带?
3楼2010-11-04 14:52:24
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playboy723

金虫 (正式写手)

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dhd997(金币+3):good 2010-11-04 18:30:35
发表下看法:
1、不建议用EXtaq,这个酶扩短点儿的片段还行,1000bp以上就会出现很多错配了,即使连上了也没法用,找个pfu系列的高保真酶扩吧,我用takara公司的primerstar酶扩3000bp没有错配或缺失,建议你用这个
2、1800bp连T载体效率已经很低了,3000bp连的话基本靠运气,成功率极低,不过你可以不断的试,直到连上为止。建议你分成2段来扩,分别连到T载体上,测序成功后再连到一起,这样把握大些。
3、PCR时退火温度高些较好,没有非特异的杂带,另外操作时尽量要严谨,避免出现不明的现象。
4楼2010-11-04 15:44:21
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friend.11

金虫 (正式写手)


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我也曾经出现过跟你一样的情况,我也不知道是为什么。我当时刚刚换了测序公司(原来是Invitrogen,后来换到华大),我以为是测序公司的问题,因为不可能连载体上的引物都找不到啊!不过我还是重做一次。
5楼2010-11-04 19:33:09
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