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【求助】DS分子对接为什么出现0pose
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xiaobao7365
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[交流]
【求助】DS分子对接为什么出现0pose
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看了别人说的0pose,有的人说口袋太大,有的人口袋太小,我都试过,而且都试了所有DS的对接模块,都是0pose,而且这个配体小分子是该蛋白晶体复合物的结构,,苦恼死了,请各位大侠指导下~~~
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1楼
2010-10-16 08:21:18
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李晓溪
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):给个红包,谢谢回帖
我做的也是小分子和蛋白的对接,是用CDOCKER做的,如果你的晶体里提到的活性位点残基较多就应该把球半径设大点,然后通过改变球心位置来确定活性区域。
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只有不敢想的,没有不敢做的
9楼
2011-09-11 14:35:42
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xiaobao7365
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我试了两天两夜,都没睡觉。。。还是找不到问题。。。晕。。
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2楼
2010-10-16 08:42:50
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xiaobao7365
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没人回答,郁闷。。。
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3楼
2010-10-16 17:42:13
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wdali
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性别: GG
专业: 环境微生物学
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小木虫(金币
+0.5
):给个红包,谢谢回帖交流
你用的是什么对接方式啊?
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统治这个世界的是想象力
4楼
2010-10-20 09:34:49
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