24小时热门版块排行榜    

查看: 3162  |  回复: 4

cecilia533

新虫 (小有名气)

[求助] DS的CDOCKER和flexible docking对接时出现的问题

CDOCKER出现的0pose是什么情况?怎么办?
flexible docking出现的ERROR说No ligand poses were docked - please check output or log files!什么情况,如何改善?两者有什么区别?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ts2009

木虫 (著名写手)

无业游民

【答案】应助回帖

★ ★
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-10-23 10:22:09
你做的对接有问题,你定义了配体小分子和对接口袋了么??
√:寂寞无边蔓延,触到无边伤感!
2楼2011-05-20 14:49:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wolveshunter

至尊木虫 (著名写手)

lz,我和你情况一样,同问啊~~~
有木有高手来解答啊~~~~
I can be destroyed, but not defeated.
3楼2011-10-21 19:50:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

李晓溪

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
zh1987hs(金币+3): 谢谢 2011-11-05 23:29:00
CDOCK出现0pose的情况有可能是你的活性球的中心位置没找对,多试几次。也有可能是你对上一步所得到的受体的处理格式不对。我的对接也出现过同样的情况,就从这两方面改善就解决了,对你的问题仅供参考,因为不同体系也不同。
只有不敢想的,没有不敢做的
4楼2011-11-05 07:55:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

daniel_tang

金虫 (小有名气)

红魔

引用回帖:
4楼: Originally posted by 李晓溪 at 2011-11-05 07:55:32:
CDOCK出现0pose的情况有可能是你的活性球的中心位置没找对,多试几次。也有可能是你对上一步所得到的受体的处理格式不对。我的对接也出现过同样的情况,就从这两方面改善就解决了,对你的问题仅供参考,因为不同体 ...

我想请教下,如果活性位点口袋比较小,而配体过大是不是也会出现0pose,我遇到过类似的问题。
player,gamer,lifer
5楼2011-11-12 15:19:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 cecilia533 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +14 爱看书的可乐 2026-08-26 16/800 2026-08-26 17:44 by skyjudy
[基金申请] 基金不中,共勉 +3 eulota 2026-08-26 3/150 2026-08-26 16:17 by 路yyyy
[基金申请] 怎么查啊 +5 huang1991js 2026-08-26 5/250 2026-08-26 16:09 by Equinoxhua
[基金申请] 我不理解! +8 Edward_pc 2026-08-26 13/650 2026-08-26 15:37 by Tide man
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 科研孤儿太难了 +21 我4大白菜 2026-08-20 22/1100 2026-08-26 11:29 by nlgza
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 明天应该可查了!? +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 22/1100 2026-08-25 15:36 by 医学老男孩
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
请填处理意见