24小时热门版块排行榜    

查看: 3165  |  回复: 4

cecilia533

新虫 (小有名气)

[求助] DS的CDOCKER和flexible docking对接时出现的问题

CDOCKER出现的0pose是什么情况?怎么办?
flexible docking出现的ERROR说No ligand poses were docked - please check output or log files!什么情况,如何改善?两者有什么区别?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ts2009

木虫 (著名写手)

无业游民

【答案】应助回帖

★ ★
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-10-23 10:22:09
你做的对接有问题,你定义了配体小分子和对接口袋了么??
√:寂寞无边蔓延,触到无边伤感!
2楼2011-05-20 14:49:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wolveshunter

至尊木虫 (著名写手)

lz,我和你情况一样,同问啊~~~
有木有高手来解答啊~~~~
I can be destroyed, but not defeated.
3楼2011-10-21 19:50:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

李晓溪

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
zh1987hs(金币+3): 谢谢 2011-11-05 23:29:00
CDOCK出现0pose的情况有可能是你的活性球的中心位置没找对,多试几次。也有可能是你对上一步所得到的受体的处理格式不对。我的对接也出现过同样的情况,就从这两方面改善就解决了,对你的问题仅供参考,因为不同体系也不同。
只有不敢想的,没有不敢做的
4楼2011-11-05 07:55:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

daniel_tang

金虫 (小有名气)

红魔

引用回帖:
4楼: Originally posted by 李晓溪 at 2011-11-05 07:55:32:
CDOCK出现0pose的情况有可能是你的活性球的中心位置没找对,多试几次。也有可能是你对上一步所得到的受体的处理格式不对。我的对接也出现过同样的情况,就从这两方面改善就解决了,对你的问题仅供参考,因为不同体 ...

我想请教下,如果活性位点口袋比较小,而配体过大是不是也会出现0pose,我遇到过类似的问题。
player,gamer,lifer
5楼2011-11-12 15:19:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 cecilia533 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的? +15 爱看书的可乐 2026-08-26 17/850 2026-08-27 00:35 by xxniao123
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +3 a089 2026-08-26 3/150 2026-08-26 23:21 by young90
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 系统查不到 +10 董八千 2026-08-26 10/500 2026-08-26 16:30 by Equinoxhua
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 怎么看青基中了没有啊 +4 叶九微 2026-08-26 4/200 2026-08-26 10:52 by xiacongxu
[基金申请] 今天务委会开完了,明天出结果吗 +19 angus9576 2026-08-25 23/1150 2026-08-26 10:03 by zp519
[基金申请] 国合现在查不到了吗? +10 chengyan1220 2026-08-24 20/1000 2026-08-26 08:57 by peasantsprig
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 让我中一个面上吧! +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 看来今天不会放榜了? +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
信息提示
请填处理意见