应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】帮忙查看引物是否合适
51/1返回列表
查看: 1366  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

pidou213

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】帮忙查看引物是否合适 已有5人参与

5‘-GTTGAACGACTGGGTCAGTTAACAGGAGCA
5’-GCCAAGGCCAAACACAGCATAATTCAAACCAGT


我的意思是想让虫友们帮忙看看：
1、GC含量
2、Tm值可否合适
3、3‘端有没有问题
4、每一条引物自身的发卡结构严重否？
5、第一条引物后面的A会不会产生错配？
谢谢



请详细解释一下，谢谢啊！！急求高手解决

[ Last edited by pidou213 on 2010-4-29 at 01:18 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
见得多爱的多
1楼 2010-04-28 23:41:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liyong1981

金虫 (正式写手)
这个你随便用个软件分析下就行了～比如primer5
赞一下 回复此楼
8楼2010-04-29 10:56:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

zjzz

木虫 (正式写手)

在通往变态的坦途上
★
plantaqp(金币+1): 2010-04-29 04:35
MM，知道为什么没有人回复吗？除了我这沙发癖的？
是因为你问的让人不知道怎么回答
你既不给模板的序列或物种，别人没法帮你分析引物是否够特异
你也不说引物是用来做什么的，没法考虑那个方面优先考虑
你不简单说说是否加酶切位点和保护碱基的，即使想帮你分析Tm，G值之类的也不太好下手。
所以说要问好一个问题也很重要啊~~~~~~~
坐完沙发飘走~请无视

[ Last edited by zjzz on 2010-4-29 at 00:53 ]
赞一下(1人) 回复此楼
终于熬成木虫了……
2楼2010-04-29 00:36:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gastrodia

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
pidou213(金币+1):可否继续帮忙 2010-04-29 01:16
plantaqp(金币+3): 2010-04-29 04:36
引物末端的碱基不太好，且太长
5‘-GTTGAACGACTGGGTCAGTTAACAGGAGCA Tm=72.48  GC=50%
5’-GCCAAGGCCAAACACAGCATAATTCAAACCAGT Tm=77 GC=45%
对于RACE，Tm值还行，GC含量第二条不合适，且两条引物太长，23-28bp即可，避免引物3'最末端5个碱基中GC不要超过2个，3‘最末一个碱基不要是G,不要问我为什么？这是经验，此外你用primerprimer5设计引物的时候不要担心错配的问题，置于扩增的产物的长度，你可以通过自己已有的序列翻译成蛋白质去blast，根据相似蛋白到5’或3‘的长度确定目的片段的长度即氨基酸乘以3，然后再加500bp左右的非翻译区即可
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2010-04-29 00:47:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pidou213

木虫 (正式写手)
我的意思是想让虫友们帮忙看看：
1、GC含量
2、Tm值可否合适
3、3‘端有没有问题
4、每一条引物自身的发卡结构严重否？
5、谢谢
引用回帖:
Originally posted by zjzz at 2010-04-29 00:36:25:
MM，知道为什么没有人回复吗？除了我这沙发癖的？
是因为你问的让人不知道怎么回答
你既不给模板的序列或物种，别人没法帮你分析引物是否够特异
你也不说引物是用来做什么的，没法考虑那个方面优先考虑
你不简 ...

赞一下 回复此楼
见得多爱的多
4楼2010-04-29 01:14:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料学硕301分求调剂 +7 Liyouyumairs 2026-03-21 7/350 2026-03-21 22:31 by peike
[考研] 311求调剂 +13 冬十三 2026-03-15 14/700 2026-03-21 22:10 by peike
[考研] 一志愿东华大学控制学硕320求调剂 +3 Grand777 2026-03-21 3/150 2026-03-21 19:23 by 简之-
[考研] 考研化学学硕调剂，一志愿985 +5 张vvvv 2026-03-15 7/350 2026-03-21 19:23 by ColorlessPI
[考研] 生物学调剂 +3 Surekei 2026-03-21 3/150 2026-03-21 18:31 by 学员8dgXkO
[考研] 材料学硕333求调剂 +3 北道巷 2026-03-18 3/150 2026-03-21 18:17 by 学员8dgXkO
[考研] 299求调剂 +4 某某某某位 2026-03-21 4/200 2026-03-21 16:30 by barlinike
[考研] 346求调剂[0856] +4 WayneLim327 2026-03-16 7/350 2026-03-21 04:02 by JourneyLucky
[考研] 307求调剂 +3 wyyyqx 2026-03-17 3/150 2026-03-21 03:20 by JourneyLucky
[考研] 华东师范大学-071000生物学-293分-求调剂 +3 研究生何瑶明 2026-03-18 3/150 2026-03-21 01:30 by JourneyLucky
[考研] 材料专业求调剂 +6 hanamiko 2026-03-18 6/300 2026-03-21 00:24 by JourneyLucky
[论文投稿] 申请回稿延期一个月，编辑同意了。但系统上的时间没变，给编辑又写邮件了，没回复 10+3 wangf9518 2026-03-17 4/200 2026-03-19 23:55 by babero
[考研] 材料学硕318求调剂 +5 February_Feb 2026-03-19 5/250 2026-03-19 23:51 by 23Postgrad
[考研] 一志愿福大288有机化学，求调剂 +3 小木虫200408204 2026-03-18 3/150 2026-03-19 13:31 by houyaoxu
[考研] 344求调剂 +6 knight344 2026-03-16 7/350 2026-03-18 20:13 by walc
[考研] 收复试调剂生 +4 雨后秋荷 2026-03-18 4/200 2026-03-18 14:16 by elevennnne
[考博] 26博士申请 +3 1042136743 2026-03-17 3/150 2026-03-17 23:30 by 轻松不少随
[考研] 材料专硕326求调剂 +6 墨煜姒莘 2026-03-15 7/350 2026-03-17 17:10 by ruiyingmiao
[考研] 11408 一志愿西电，277分求调剂 +3 zhouzhen654 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:03 by laoshidan
[考研] 0856求调剂 +3 刘梦微 2026-03-15 3/150 2026-03-16 10:00 by houyaoxu
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭