DNA单链退火形成双链
我自己设计了两条完全互补的DNA单链,用纯水稀释,95℃热激5min,室温退火,通过凝胶电泳验证,发现只能形成很少的双链。但是用同样的操作处理文献中的两条单链DNA,是能够成功合成大量的双链的。有没有大佬知道这是什么问题?
自己在网上尝试了几种退火缓冲,也更改过热激温度,但效果不明显,到现在还是只有极少数的双链,大部分序列还是单链,问题到底出在哪里
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我自己设计了两条完全互补的DNA单链,用纯水稀释,95℃热激5min,室温退火,通过凝胶电泳验证,发现只能形成很少的双链。但是用同样的操作处理文献中的两条单链DNA,是能够成功合成大量的双链的。有没有大佬知道这是什么问题?
自己在网上尝试了几种退火缓冲,也更改过热激温度,但效果不明显,到现在还是只有极少数的双链,大部分序列还是单链,问题到底出在哪里
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你可以问一下合成序列的公司,让他们的销售联系一下技术服务。一般大一点公司都会做这些。
我没做过这个,但是感觉这个要精确控制降温速度吧!降低退火降温速度,试试梯度降温?
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短双链退火是一件很容易的事情,随便做都能成功
长链、高GC含量、有复杂二级结构的,延长高温时间、用PCR仪缓慢降温、加DMSO
你设计的片段有自身二聚体产生
用Unpack模拟分析一下
在一定浓度的含镁离子(2-10mM)的tris缓冲溶液退火即可