预期的链置换信号放大反应没有发生
求助各位大佬,本人在做分子信标识别(MB)和信号放大方面的工作,T是靶标核酸链,B是理论上能将与MB结合的T替换下来,游离的T再次与MB反应,以实现T的量放大的效果。具体步骤如下:
1、MB探针溶于缓冲溶液(10mM Tris-HCl,2mM EDTA,5mM MgCl2),95℃加热5min,缓慢冷却至4℃,得到发夹状MB。B直接溶于缓冲溶液备用(10mM Tris-HCl,2mM EDTA)。
2、取MB于PBS溶液中,37℃孵育30min。测定荧光强度记作F0。
3、取MB和T适量于PBS溶液中,37℃孵育30min。测定荧光强度记作F1。
4、取MB和B适量于PBS溶液中,37℃孵育30min。测定荧光强度记作F2。
5、取MB和T适量于PBS溶液中,37℃孵育30min。取出,加入B探针,37℃孵育30min。测定荧光强度记作F3。
以上反应,MB:T:B为10:1:5。
结果发现荧光强度F0<F1<F2≈F3,理论上F3是明显大于F2的,不知为何,检测到的信号强度没有明显提高。目前推测是链B没有将T置换以致F2与F3相近,不知各位大佬有无别的看法,或者具体一些的建议?
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京公网安备 11010802022153号
molecular beacon的当量为10,B会优先和游离的过量molecular beacon结合而不会去竞争T,F2就应该约等于F3
那是否建议尝试一下10:1:10
,
37°C足够打开MB么? 能否加热后退火?