同分异构体
或者就是同一种物质可以有两种存在形式，两种形式可以自发地相互转化达到一个平衡。
区别方法就是把单独分离出来的不同峰再做HPLC，看看是不是一个峰又变成了两个峰。

粗肽的话一般就是不同的分子，但也要具体情况具体分析：比如说这个多肽带不带半胱氨酸（会形成二聚体，二硫键），这个多肽有没有带有芳香共轭体系的氨基酸（会不会在280nm产生吸收，如果没有的话就不能用280nm检测峰），这个多肽是不是来自天然产物（有没有自带的糖基化，磷酸化修饰）
楼主只提了hplc，没有交代样品是什么，样品怎么来的，用的柱子是什么，流动相是什么，质谱只有一个主峰还是有很多峰。所以很难判断，