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基因全长老是P不出来怎么办

作者 北海myth
来源: 小木虫 300 6 举报帖子
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2270bp的片段,一直P不出来,经常P出其他东西,有没有大神指点一下,怎么设计引物才能P出来

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  • 精华评论
  • jurkat.1640

    Takara PS-GXL比较好用

  • 犹怜草木青

    引物设计长一些,降低退火温度,换酶,南京诺唯赞的高保真酶还是很厉害的~要不要试试?

  • fengqingrusi

    P不出来全长基因有多方面的原因。
    首先需要考虑的是引物设计。对于比较长的基因,引物设计可以多试几对(一般设计3~4对,如果自己设计有困难可以考虑招公司帮忙设计),引物长度也可以考虑设计长一点(一般不超过35bp);
    其次需要考虑的是用来做模版的cDNA质量。模版cDNA的质量决定了你能不能最终拿到目的基因;有一些基因的表达量在不同细胞里面表达量不同,可以考虑找一个表达量高的细胞来提取RNA,然后做反转录得到模版cDNA,然后再去PCR;
    再次就是PCR所使用的酶。对于长片段而言,也许需要用保真度高的PCR酶,我之前用过NEB公司的高保真酶,效果不错;如果PCR得到是有错误序列的片段,可以考虑换酶;如果是P到的是其他的片段,有可能是因为模版或者引物设计的问题;
    最后需要考虑的是优化PCR的程序。这个需要自己慢慢去摸索,每个基因有一些特定的程序,我曾经P过3k、4k的片段,也是摸索了很长时间。退火温度、延伸时间以及循环数都是要摸索和优化的。PCR是一门很大的学问,能做好PCR实验,基本上就爬过了生物学实验的第一座大山,其他的实验会就会相对简单一些。最后祝实验顺利,

  • wangyuan0929

    引用回帖:
    5楼: Originally posted by fengqingrusi at 2020-08-27 15:54:29
    P不出来全长基因有多方面的原因。
    首先需要考虑的是引物设计。对于比较长的基因,引物设计可以多试几对(一般设计3~4对,如果自己设计有困难可以考虑招公司帮忙设计),引物长度也可以考虑设计长一点(一般不超过 ...

    NEB的酶,有钱人

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