没问题的，好好按实际情况写结题报告即可，把实验数据（发表或还未发表的）写入结题报告

注意：国家设置国家自然科学基金，相比于其它国家重点研发计划项目（经费数额大，任务书中必须严格列出确切的技术指标便于考核），国家自然科学基金的经费很少，就是为了鼓励探索性研究，探索性的研究（不同于国家科技计划项目）不需要提前列技术指标，就是为了鼓励大家大胆去努力攻克“卡脖子”问题，做真正有价值的纯基础研究（理科）或者应用基础研究（工科）。只要国家自科评审人认可了你作为申请人的申请书是面向“卡脖子”关键问题的，并提出了令同行评审人认可的探索性研究路线即可。
为了避免目前大家都为发论文做“避重就轻”的研究，近期国家自然科学基金委的文件中已经经常出现“鼓励大胆探索”、攻克“卡脖子”难题、“不怕失败”等词汇了，

有研究成果，但研究成果没有发表，可能不会影响结题，但对以后的项目申请不利。

可以