北京农学院课题组破译中国板栗全基因组
北京农学院课题组与天津生物芯片等单位合作项目,Hybrid de novogenome assembly of Chinese chestnut (Castanea mollissima),于2019年9月19日《Gigascience》杂志在线发表,该研究基于PacBio 长读长测序技术,组装及注释了中国板栗基因组,是栗属植物中第一个完成基因组测序的树种。
根据BUSCO分析,基因组完整性为96.7%。与三个近缘物种Quercus robur、Fagus sylvatica和Juglans regia的基因组相比,中国板栗具有8884个特有基因家族和11,952个特有基因。基因组进化分析表明中国板栗和Quercus robur的分化发生在1362万年前。
基于此研究结果为栗属植物中第一个完成基因组测序的树种,高质量的中国板栗基因组图谱为栗属植物的起源进化、遗传改良等研究奠定了重要的基础,包含植物科学最前沿、iPlants等多家媒体都对此研究做了详细报道,这充分表明该文章的学术价值。
板栗文章.jpg
板栗基因组组装.jpg
板栗文章.jpg
板栗文章文章2.jpg 返回小木虫查看更多
今日热帖
,