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请问用T-RFLP技术处理样品后,怎么分析数据

作者 JUJUNFENG
来源: 小木虫 150 3 举报帖子
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最近做用T-RFLP技术测定了污染物对不同土壤细菌多样性的影响,但没有测序没有建库,得到的只是片段信息,而且也不打算建库了,得到数据后本小弱不会分析,根据查到的文献,对大概可以进行的分析总结了下,主要有香浓和辛普森指数分析,主成分分析,以及不同样品中细菌相似度的分析,另外还可以根据网上的比对信息推测细菌的种属,但不知道还有什么分析可以做?而且小弱以前没做过这个,数据分析的具体操作不懂唉,有没有虫友能提供帮助,推荐几款软件和网站啥的,在下感激不尽 返回小木虫查看更多

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  • 精华评论
  • JUJUNFENG

    自己顶,别沉,还有个问题想补充下,算多样性之前需要将长度小于50bp,丰度小于1%的片段都去掉?还是只去掉小于50的片段就可以了,丰度小于1%的片段需要保留呢?

  • 美亿美生物

    T-RFLP 的试验我们可以提供服务,关于分析大致也就您说的这些了。

  • JUJUNFENG

    引用回帖:
    3楼: Originally posted by 美亿美生物 at 2016-10-25 11:01:59
    T-RFLP 的试验我们可以提供服务,关于分析大致也就您说的这些了。

    谢谢

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