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四、乳酸菌基因组学和蛋白质组学的研究 2008年，在国内首次完成了益生乳酸菌L.casei Zhang的基因组学和蛋白质组学研究，该研究成果填补了我国利用现代组学方法系统研究乳酸菌的空白。 为了全面解析乳酸菌菌株的遗产背景和相关的功能基因，2009-2010年，相继完成了B. animalis V9、L. fermentum F-6、L. plantarum P-8、L. helveticus H9、L. bulgaricus ND02、S. thermophilus ND03等具有工业化应用价值的6株乳酸菌株的基因组学和蛋白质组学的研究。这些基础研究为菌株的产业化提供了更有力的科学保证。 五、中国健康人群肠道微生物构成的研究 中国作为一个多民族、地域辽阔和食物多样的国家，特别是中国人群的居住环境、饮食和生活习惯均与西方人群有较大差异,那么,占世界人口近1/5的中国人群肠道菌群构成是一个什么样的情况?目前了解甚少。2010年，本实验室共从中国9个省份采集到汉族、壮族、维吾尔族、哈萨克族、蒙古族、藏族和白族等7个民族314份健康志愿者的粪便样品。应用454焦磷酸测序技术对中国人肠道菌群多样性进行了分析。 研究结果表明：中国健康人群肠道菌群主要由隶属于Firmicutes (硬壁菌门)和 Bacteroidetes (拟杆菌门)的若干个属的细菌组成。中国人群肠道微生物构成总体上是连续的，不存在明显聚类现象，相对于欧洲人群而言，中国人群肠道菌群结构呈现出更为复杂和多样的特点。膳食、性别、民族、城乡居住地及后两者结合因素对肠道菌群构成有显著影响作用。 http://www.bio149.cn/html/resear ... GD02012/1680_2.html [ Last edited by zhangxingc on 2013-3-8 at 13:25 ]
中科院微生物所做乳酸菌很强大
2楼说的好、、、介绍到前面了。
我这有近几年一些关于肠道菌群研究的国家自然科学基金项目的信息，从中你可以看到是谁和哪些单位在做。一般来说，这些人和单位还是属于国内做的比较好的。 1. 草鱼肠道微生物群落结构对不同食物的适应性变化机制研究 负责人：吴山功 参与人：程莹寅, 王微微, 卢明淼, 李欢 金额：78万 申请时间：2012 学科代码：水产生物研究的新技术和新方法(C1908) 项目批准号：31272706 申请单位：中国科学院水生生物研究所 研究类型：基础研究 关键词：草鱼;肠道;微生物群落结构;食物消化相关微生物;454焦磷酸测序技术 2. 轻型肝性脑病相关的肠道微生物宏基因组深度测序分析 负责人：范红 参与人：张志刚, 耿嘉蔚, 叶志强, 王维, 彭伟, 王芸, 寻琳婷, 翟慧勤, 杨超 金额：47万 申请时间：2012 学科代码：肝脏代谢障碍及相关疾病(H0314) 项目批准号：81260077 申请单位：云南省第一人民医院 研究类型：基础研究 关键词：轻型肝性脑病;肝硬化;肠道微生物组;氨代谢;深度宏基因组测序 3. BdDUOX和BdRelish在橘小实蝇肠道微生物群落稳态维持中的作用机理 负责人：石章红 参与人：黄胜威, 王平坪, 姚志超, 李杖黎 金额：22万 申请时间：2012 学科代码：经济及其他作物害虫(C140205) 项目批准号：31201522 申请单位：华中农业大学 研究类型：基础研究 关键词：橘小实蝇;肠道微生物;活性氧;抗菌肽;稳态 4. 肠道微生物群对遗传性非息肉病性结直肠癌发病的影响 负责人：盛剑秋 参与人：李恕军, 陆晓娟, 郭花, 卢俊宇, 王昕, 赵晓军, 商一鸣 金额：70万 申请时间：2012 学科代码：肿瘤病因(H1601) 项目批准号：81272194 申请单位：中国人民解放军北京军区总医院 研究类型：基础研究 关键词：遗传性结直肠癌;肠道微生物群;肿瘤发生;宏基因组学 5. 瑞士乳杆菌NS-8对结肠癌的干预及机制的探讨 负责人：戎晶晶 参与人：戎晶晶, 胡旭, 刘名, 吉顺, 王涛, 李薇, 梁姗 金额：22万 申请时间：2011 学科代码：肿瘤预防(H1605) 项目批准号：81101560 申请单位：中国科学院遗传与发育生物学研究所 研究类型：基础研究 关键词：NS-8乳杆菌；益生菌；结肠癌；肠道微生物 6. Autoimmune diseases therapies: variations on the microbiome in rheumatoid arthritis 负责人：ChristineNardini 参与人：Christine Nardini, 刘元花, JenniferE.Dent, 梁永瑛, 郭艳明, 朱丽莎, 杨馨怡, 卢有韬, 黄毅 金额：60万 申请时间：2011 学科代码：生物信息学研究新技术与新方法(C060706) 项目批准号：31171277 申请单位：中国科学院上海生命科学研究院 研究类型：应用基础研究 关键词：慢性自免疫疾病；肠道微生物组；类风湿性关节炎 7. 大额牛胃肠道微生物宏基因组研究及纤维素分解酶类功能基因筛选 负责人：黄遵锡 参与人：黄遵锡, 许波, 周峻沛, 唐湘华, 李俊俊, 刘凌云, 杨富亚, 杨芳 金额：65万 申请时间：2011 学科代码：原核微生物遗传(C060301) 项目批准号：31160229 申请单位：云南师范大学 研究类型：应用基础研究 关键词：大额牛；胃肠道微生物；宏基因组；纤维素分解酶；高通量测序 8. 肠道微生物适应极酸性环境的结构生物学与分子机理研究 负责人：施一公 参与人：施一公, 张曦, 肖乐, 殷平, 任若冰, 王翊, 高翔, 曾昕, 周丽君, 李晓淳 金额：290万 申请时间：2011 学科代码：环境微生物学(C0105) 项目批准号：31130002 申请单位：清华大学 研究类型：基础研究 关键词：微生物抗酸性系统；膜转运蛋白；结构生物学 9. 肠道微生物降解产生雌马酚的分子机制研究及其双相连续发酵生产模型的构建 负责人：尹业师 参与人：尹业师, 刘伟, 李锐, 雷芳, 陈波, 王宇 金额：22万 申请时间：2011 学科代码：其他环境微生物学(C010503) 项目批准号：31100097 申请单位：浙江省农业科学院 研究类型：应用基础研究 关键词：雌马酚；功能元基因组学；基因簇；遗传改造；连续发酵 10. 基于高通量测序数据分析的微生物鉴定新方法及其在人类肠道微生物研究中的应用 负责人：戚继 参与人：戚继, 杨洪星, 王海峰, 陈雅毛 金额：23万 申请时间：2011 学科代码：其他环境微生物学(C010503) 项目批准号：31100094 申请单位：复旦大学 研究类型：基础研究 关键词：环境微生物；物种识别；高通量测序 11. 短链脂肪酸受体介导肠道微生物调节猪脂代谢的分子机理 负责人：姚文 参与人：姚文, 李忠平, 苏勇, 丁立人, 李根来, 黄莎娜, 郑卫江, 田文生, 田书会 金额：36万 申请时间：2010 学科代码：单胃动物营养学(C170105) 项目批准号：31072035 申请单位：南京农业大学 研究类型：应用基础研究 关键词：肠道微生物，短链脂肪酸（SCFA），G蛋白偶联受体（GPR41、43），猪脂代谢 12. 初生动物肠道菌群定植及对宿主基因表达的影响 负责人：王欣 参与人：王欣, 王新, 章学东, 张伟武, 朱立颖, 尹业师, 廖宁波, 张涛, 杨廷武 金额：30万 申请时间：2009 学科代码：其他环境微生物学(C010503) 项目批准号：30970108 申请单位：浙江省农业科学院 研究类型：基础研究 关键词：肠道微生物、分子微生物生态、微生物代谢、动物营养 13. 通过麦蛾幼虫肠道微生物区系结构研究进一步研究降解聚乙烯降解机理 负责人：宋怡玲 参与人：宋怡玲, 杨军, 刘洪新, 呼庆, 潘洪 金额：9万 申请时间：2010 学科代码：固体废弃物污染化学(B070204) 项目批准号：21011120247 申请单位：北京航空航天大学 研究类型：基础研究 14. 倭蜂猴肠道微生物宏基因组文库构建及水解酶功能基因筛选 负责人：许波 参与人：许波, 余尊祥, 慕跃林, 杨云娟, 唐湘华, 高润池, 洪涛, 谢振荣 金额：24万 申请时间：2009 学科代码：微生物遗传学(C0603) 项目批准号：30960165 申请单位：云南师范大学 研究类型：应用基础研究 关键词：倭蜂猴；肠道微生物；宏基因组；水解酶；筛选 15. 人肠道微生物组的基因预测与序列拼接方法研究 负责人：朱怀球 参与人：朱怀球, 胡钢清, 康宏, 刘永初, 罗成伟, 郭江涛, 曲姣, 赖彬彬 金额：32万 申请时间：2009 学科代码：系统生物学(C0505) 项目批准号：30970667 申请单位：北京大学 研究类型：应用基础研究 关键词：宏基因组；肠道微生物；基因预测；序列拼接 16. GF小鼠模型研究肠道微生态影响大豆异黄酮对LXRα介导的脂代谢信号传导 负责人：张玉梅 参与人：张玉梅, JosephJRafter, 闫少芳, 史宇晖, 邱敏, 李贤标, 万忠晓, 沈小毅 金额：31万 申请时间：2008 学科代码：人类营养(H2603) 项目批准号：30872115 申请单位：北京大学 研究类型：基础研究 关键词：大豆异黄酮；GM模型小鼠；脂代谢；LXRα；肠道微生物 17. 仔猪肠道健康营养调控的微生物组学研究 负责人：朱伟云 参与人：朱伟云, 姚文, 苏勇, 毛胜勇, 罗玉衡, 戴兆来, 张逊, 张京, 牟明生 金额：100万 申请时间：2008 学科代码：家禽营养学(C170106) 项目批准号：30810103909 申请单位：南京农业大学 研究类型：应用基础研究 关键词：肠道微生物；微生物与肠壁交互作用；植物提取物；基因芯片；功能基因组学 18. 苦豆籽粕-双歧杆菌合生元对鸡肠道微生物区系影响的研究 负责人：杨英 参与人：杨英, 夏雅娟, 杜雅楠, 王乃凤, 张剑柄, 赵志永, 朱国峰, 张峰, 孟萌 金额：17万 申请时间：2007 学科代码：中兽医学(C1806) 项目批准号：30760179 申请单位：内蒙古农业大学 研究类型：应用基础研究 关键词：苦豆籽粕；双歧杆菌；合生元；鸡 19. 肠道微生物群落的结构动力学与功能解析研究 负责人：赵立平 参与人：赵立平, 王升跃, 于志杰, 张梦辉, 庞小燕, 曹又方, 申剑, 李旻, 张晨虹, 王婷婷 金额：165万 申请时间：2007 学科代码：其他环境微生物学(C010503) 项目批准号：30730005 申请单位：上海交通大学 研究类型：应用基础研究 关键词：肠道菌群；分子生态学；群落结构；环境基因标签；DNA指纹图 20. 贡嘎蝠蛾肠道微生物区系及其对宿主影响的研究 负责人：殷幼平 金额：25万 申请时间：2005 学科代码：中药质量评价(H2804) 项目批准号：30572325 申请单位：重庆大学 研究类型：应用基础研荆�
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继续求助，不知道还有没有肠道微生物方面的研究信息
兰州生物所，山东齐鲁药业都还可以
华中科技大学同济医学院微生物
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京公网安备 11010802022153号
四、乳酸菌基因组学和蛋白质组学的研究
2008年，在国内首次完成了益生乳酸菌L.casei Zhang的基因组学和蛋白质组学研究，该研究成果填补了我国利用现代组学方法系统研究乳酸菌的空白。
为了全面解析乳酸菌菌株的遗产背景和相关的功能基因，2009-2010年，相继完成了B. animalis V9、L. fermentum F-6、L. plantarum P-8、L. helveticus H9、L. bulgaricus ND02、S. thermophilus ND03等具有工业化应用价值的6株乳酸菌株的基因组学和蛋白质组学的研究。这些基础研究为菌株的产业化提供了更有力的科学保证。
五、中国健康人群肠道微生物构成的研究
中国作为一个多民族、地域辽阔和食物多样的国家，特别是中国人群的居住环境、饮食和生活习惯均与西方人群有较大差异,那么,占世界人口近1/5的中国人群肠道菌群构成是一个什么样的情况?目前了解甚少。2010年，本实验室共从中国9个省份采集到汉族、壮族、维吾尔族、哈萨克族、蒙古族、藏族和白族等7个民族314份健康志愿者的粪便样品。应用454焦磷酸测序技术对中国人肠道菌群多样性进行了分析。
研究结果表明：中国健康人群肠道菌群主要由隶属于Firmicutes (硬壁菌门)和 Bacteroidetes (拟杆菌门)的若干个属的细菌组成。中国人群肠道微生物构成总体上是连续的，不存在明显聚类现象，相对于欧洲人群而言，中国人群肠道菌群结构呈现出更为复杂和多样的特点。膳食、性别、民族、城乡居住地及后两者结合因素对肠道菌群构成有显著影响作用。
http://www.bio149.cn/html/resear ... GD02012/1680_2.html
[ Last edited by zhangxingc on 2013-3-8 at 13:25 ]
中科院微生物所做乳酸菌很强大
2楼说的好、、、介绍到前面了。
我这有近几年一些关于肠道菌群研究的国家自然科学基金项目的信息，从中你可以看到是谁和哪些单位在做。一般来说，这些人和单位还是属于国内做的比较好的。
1. 草鱼肠道微生物群落结构对不同食物的适应性变化机制研究
负责人：吴山功 参与人：程莹寅, 王微微, 卢明淼, 李欢
金额：78万 申请时间：2012 学科代码：水产生物研究的新技术和新方法(C1908) 项目批准号：31272706
申请单位：中国科学院水生生物研究所 研究类型：基础研究
关键词：草鱼;肠道;微生物群落结构;食物消化相关微生物;454焦磷酸测序技术
2. 轻型肝性脑病相关的肠道微生物宏基因组深度测序分析
负责人：范红 参与人：张志刚, 耿嘉蔚, 叶志强, 王维, 彭伟, 王芸, 寻琳婷, 翟慧勤, 杨超
金额：47万 申请时间：2012 学科代码：肝脏代谢障碍及相关疾病(H0314) 项目批准号：81260077
申请单位：云南省第一人民医院 研究类型：基础研究
关键词：轻型肝性脑病;肝硬化;肠道微生物组;氨代谢;深度宏基因组测序
3. BdDUOX和BdRelish在橘小实蝇肠道微生物群落稳态维持中的作用机理
负责人：石章红 参与人：黄胜威, 王平坪, 姚志超, 李杖黎
金额：22万 申请时间：2012 学科代码：经济及其他作物害虫(C140205) 项目批准号：31201522
申请单位：华中农业大学 研究类型：基础研究
关键词：橘小实蝇;肠道微生物;活性氧;抗菌肽;稳态
4. 肠道微生物群对遗传性非息肉病性结直肠癌发病的影响
负责人：盛剑秋 参与人：李恕军, 陆晓娟, 郭花, 卢俊宇, 王昕, 赵晓军, 商一鸣
金额：70万 申请时间：2012 学科代码：肿瘤病因(H1601) 项目批准号：81272194
申请单位：中国人民解放军北京军区总医院 研究类型：基础研究
关键词：遗传性结直肠癌;肠道微生物群;肿瘤发生;宏基因组学
5. 瑞士乳杆菌NS-8对结肠癌的干预及机制的探讨
负责人：戎晶晶 参与人：戎晶晶, 胡旭, 刘名, 吉顺, 王涛, 李薇, 梁姗
金额：22万 申请时间：2011 学科代码：肿瘤预防(H1605) 项目批准号：81101560
申请单位：中国科学院遗传与发育生物学研究所 研究类型：基础研究
关键词：NS-8乳杆菌；益生菌；结肠癌；肠道微生物
6. Autoimmune diseases therapies: variations on the microbiome in rheumatoid arthritis
负责人：ChristineNardini 参与人：Christine Nardini, 刘元花, JenniferE.Dent, 梁永瑛, 郭艳明, 朱丽莎, 杨馨怡, 卢有韬, 黄毅
金额：60万 申请时间：2011 学科代码：生物信息学研究新技术与新方法(C060706) 项目批准号：31171277
申请单位：中国科学院上海生命科学研究院 研究类型：应用基础研究
关键词：慢性自免疫疾病；肠道微生物组；类风湿性关节炎
7. 大额牛胃肠道微生物宏基因组研究及纤维素分解酶类功能基因筛选
负责人：黄遵锡 参与人：黄遵锡, 许波, 周峻沛, 唐湘华, 李俊俊, 刘凌云, 杨富亚, 杨芳
金额：65万 申请时间：2011 学科代码：原核微生物遗传(C060301) 项目批准号：31160229
申请单位：云南师范大学 研究类型：应用基础研究
关键词：大额牛；胃肠道微生物；宏基因组；纤维素分解酶；高通量测序
8. 肠道微生物适应极酸性环境的结构生物学与分子机理研究
负责人：施一公 参与人：施一公, 张曦, 肖乐, 殷平, 任若冰, 王翊, 高翔, 曾昕, 周丽君, 李晓淳
金额：290万 申请时间：2011 学科代码：环境微生物学(C0105) 项目批准号：31130002
申请单位：清华大学 研究类型：基础研究
关键词：微生物抗酸性系统；膜转运蛋白；结构生物学
9. 肠道微生物降解产生雌马酚的分子机制研究及其双相连续发酵生产模型的构建
负责人：尹业师 参与人：尹业师, 刘伟, 李锐, 雷芳, 陈波, 王宇
金额：22万 申请时间：2011 学科代码：其他环境微生物学(C010503) 项目批准号：31100097
申请单位：浙江省农业科学院 研究类型：应用基础研究
关键词：雌马酚；功能元基因组学；基因簇；遗传改造；连续发酵
10. 基于高通量测序数据分析的微生物鉴定新方法及其在人类肠道微生物研究中的应用
负责人：戚继 参与人：戚继, 杨洪星, 王海峰, 陈雅毛
金额：23万 申请时间：2011 学科代码：其他环境微生物学(C010503) 项目批准号：31100094
申请单位：复旦大学 研究类型：基础研究
关键词：环境微生物；物种识别；高通量测序
11. 短链脂肪酸受体介导肠道微生物调节猪脂代谢的分子机理
负责人：姚文 参与人：姚文, 李忠平, 苏勇, 丁立人, 李根来, 黄莎娜, 郑卫江, 田文生, 田书会
金额：36万 申请时间：2010 学科代码：单胃动物营养学(C170105) 项目批准号：31072035
申请单位：南京农业大学 研究类型：应用基础研究
关键词：肠道微生物，短链脂肪酸（SCFA），G蛋白偶联受体（GPR41、43），猪脂代谢
12. 初生动物肠道菌群定植及对宿主基因表达的影响
负责人：王欣 参与人：王欣, 王新, 章学东, 张伟武, 朱立颖, 尹业师, 廖宁波, 张涛, 杨廷武
金额：30万 申请时间：2009 学科代码：其他环境微生物学(C010503) 项目批准号：30970108
申请单位：浙江省农业科学院 研究类型：基础研究
关键词：肠道微生物、分子微生物生态、微生物代谢、动物营养
13. 通过麦蛾幼虫肠道微生物区系结构研究进一步研究降解聚乙烯降解机理
负责人：宋怡玲 参与人：宋怡玲, 杨军, 刘洪新, 呼庆, 潘洪
金额：9万 申请时间：2010 学科代码：固体废弃物污染化学(B070204) 项目批准号：21011120247
申请单位：北京航空航天大学 研究类型：基础研究
14. 倭蜂猴肠道微生物宏基因组文库构建及水解酶功能基因筛选
负责人：许波 参与人：许波, 余尊祥, 慕跃林, 杨云娟, 唐湘华, 高润池, 洪涛, 谢振荣
金额：24万 申请时间：2009 学科代码：微生物遗传学(C0603) 项目批准号：30960165
申请单位：云南师范大学 研究类型：应用基础研究
关键词：倭蜂猴；肠道微生物；宏基因组；水解酶；筛选
15. 人肠道微生物组的基因预测与序列拼接方法研究
负责人：朱怀球 参与人：朱怀球, 胡钢清, 康宏, 刘永初, 罗成伟, 郭江涛, 曲姣, 赖彬彬
金额：32万 申请时间：2009 学科代码：系统生物学(C0505) 项目批准号：30970667
申请单位：北京大学 研究类型：应用基础研究
关键词：宏基因组；肠道微生物；基因预测；序列拼接
16. GF小鼠模型研究肠道微生态影响大豆异黄酮对LXRα介导的脂代谢信号传导
负责人：张玉梅 参与人：张玉梅, JosephJRafter, 闫少芳, 史宇晖, 邱敏, 李贤标, 万忠晓, 沈小毅
金额：31万 申请时间：2008 学科代码：人类营养(H2603) 项目批准号：30872115
申请单位：北京大学 研究类型：基础研究
关键词：大豆异黄酮；GM模型小鼠；脂代谢；LXRα；肠道微生物
17. 仔猪肠道健康营养调控的微生物组学研究
负责人：朱伟云 参与人：朱伟云, 姚文, 苏勇, 毛胜勇, 罗玉衡, 戴兆来, 张逊, 张京, 牟明生
金额：100万 申请时间：2008 学科代码：家禽营养学(C170106) 项目批准号：30810103909
申请单位：南京农业大学 研究类型：应用基础研究
关键词：肠道微生物；微生物与肠壁交互作用；植物提取物；基因芯片；功能基因组学
18. 苦豆籽粕-双歧杆菌合生元对鸡肠道微生物区系影响的研究
负责人：杨英 参与人：杨英, 夏雅娟, 杜雅楠, 王乃凤, 张剑柄, 赵志永, 朱国峰, 张峰, 孟萌
金额：17万 申请时间：2007 学科代码：中兽医学(C1806) 项目批准号：30760179
申请单位：内蒙古农业大学 研究类型：应用基础研究
关键词：苦豆籽粕；双歧杆菌；合生元；鸡
19. 肠道微生物群落的结构动力学与功能解析研究
负责人：赵立平 参与人：赵立平, 王升跃, 于志杰, 张梦辉, 庞小燕, 曹又方, 申剑, 李旻, 张晨虹, 王婷婷
金额：165万 申请时间：2007 学科代码：其他环境微生物学(C010503) 项目批准号：30730005
申请单位：上海交通大学 研究类型：应用基础研究
关键词：肠道菌群；分子生态学；群落结构；环境基因标签；DNA指纹图
20. 贡嘎蝠蛾肠道微生物区系及其对宿主影响的研究
负责人：殷幼平
金额：25万 申请时间：2005 学科代码：中药质量评价(H2804) 项目批准号：30572325
申请单位：重庆大学 研究类型：应用基础研荆�
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继续求助，不知道还有没有肠道微生物方面的研究信息
兰州生物所，山东齐鲁药业都还可以
华中科技大学同济医学院微生物