小木虫

当前位置：首页 > 分子模拟 >大家autodock一般都跑多久？

大家autodock一般都跑多久？

作者 河外生命: 来源: 小木虫 250 5 举报帖子

+关注

我的系统是win7 64位，配置为i5四核，8G内存，NV独显1g现存。跑教程给的HIV抑制剂的例子，怎么到现在运行了一个多小时都没结束？之前跑autogrid时间也比在xp下要长，是不是哪里有问题？请高手解答，谢谢！返回小木虫查看更多

今日热帖

精华评论

houxuben

autodock跑单次对接对机器要求不高，配置高速度也提不上去，把run的参数写上，不知道你跑多少步，我自己跑一般十几分钟到一小时吧，很少超过两小时，可能你的参数调的太高了
houxuben

autodock跑单次对接对机器要求不高，配置高速度也提不上去，把run的参数写上，不知道你跑多少步，我自己跑一般十几分钟到一小时吧，很少超过两小时，可能你的参数调的太高了
河外生命

引用回帖:
3楼: Originally posted by houxuben at 2012-09-06 12:26:58
autodock跑单次对接对机器要求不高，配置高速度也提不上去，把run的参数写上，不知道你跑多少步，我自己跑一般十几分钟到一小时吧，很少超过两小时，可能你的参数调的太高了
...

我是按照教程的默认配置：Number of GA runs:100
population size:150
Maximum number of evals:250000;
其它都是默认的。
奇怪的是我在XP里十几分钟就跑完了，在win7里现在跑了五六个小时了怎么都没有结束
，
houxuben

引用回帖:
4楼: Originally posted by 河外生命 at 2012-09-06 15:59:51
我是按照教程的默认配置：Number of GA runs:100
population size:150
Maximum number of evals:250000;
其它都是默认的。
奇怪的是我在XP里十几分钟就跑完了，在win7里现在跑了五六个小时了怎么都没有结束。...

没有尝试过在WIN下面跑，不知是否有可能进入死循环?建议可以再WIN下装个虚拟机，在LINUX系统下做计算，保险点
longdlut

曾经在win7下面计算过，10次的运算量跑啦3h。。。。
换成linux，变成啦10min。。。。。。