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使用Towhee做NVT模拟时，气液两盒子的hmatrix 大小该怎么设置？有什么原则或公式么？

作者 hy5186681: 来源: 小木虫 350 7 举报帖子

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使用Towhee做NVT模拟时，towhhe_input文件中，气液两盒子的hmatrix 大小该怎么设置？
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043114076

根据体系的密度设置
hy5186681

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2楼: Originally posted by 043114076 at 2012-08-31 09:14:11
根据体系的密度设置

不太懂，麻烦你简单举个例子吧，谢谢哈
043114076

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3楼: Originally posted by hy5186681 at 2012-09-03 11:36:22
不太懂，麻烦你简单举个例子吧，谢谢哈...

比如水的密度是1g/ml, 首先求出单位体积（埃^3）内的水分子数，然后根据你想模拟水分子数求出体积，然后再根据体积算出立方体每个边的边长
hy5186681

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4楼: Originally posted by 043114076 at 2012-09-03 12:26:14
比如水的密度是1g/ml, 首先求出单位体积（埃^3）内的水分子数，然后根据你想模拟水分子数求出体积，然后再根据体积算出立方体每个边的边长...

懂了，Thanks！
hy5186681

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4楼: Originally posted by 043114076 at 2012-09-03 12:26:14
比如水的密度是1g/ml, 首先求出单位体积（埃^3）内的水分子数，然后根据你想模拟水分子数求出体积，然后再根据体积算出立方体每个边的边长...

还想请教你一个问题，
比如说我要用NVT做相平衡模拟，一种分子类型，比如说水吧，两个盒子，共有200分子；
已知模拟温度为T，相平衡时气液密度分别为r1，r2；
请问初始输入中怎么确定两个盒子（气相和液相）中气、液分子数分别为多少？
比如50+150，还是100+100等等，请问有什么原则么，谢谢
，
043114076

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6楼: Originally posted by hy5186681 at 2012-09-03 21:57:49
还想请教你一个问题，
比如说我要用NVT做相平衡模拟，一种分子类型，比如说水吧，两个盒子，共有200分子；
已知模拟温度为T，相平衡时气液密度分别为r1，r2；
请问初始输入中怎么确定两个盒子（气相和液相）中 ...

我自己的理解应该是每一相的分子数都应该达到收敛，也就是模拟体系的结构和性质需要的最少的分子数目，比较简便的方法是直接用文献中的数。一般气相分子少一些，液相分子需要多一些。
hy5186681

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7楼: Originally posted by 043114076 at 2012-09-04 09:43:46
我自己的理解应该是每一相的分子数都应该达到收敛，也就是模拟体系的结构和性质需要的最少的分子数目，比较简便的方法是直接用文献中的数。一般气相分子少一些，液相分子需要多一些。...

噢，自己随便设的哈，Thanks ！