QM/MM软件的选择
各位专家虫友们,大家好。老板让学下QM/MM软件,因此想选择性能好,又较易上手的QM/MM软件组合学习一下。我比较熟悉Gamess软件,NAMD软件也熟悉,Gaussian软件将就。这是我的基本情况。我的问题如下:
(1)如果能将NAMD和Gamess结合做QM/MM那就太好了,但是查了一些资料,好像NAMD没有QM的接口。但是在NAMD的官网上还是有QM/MM的计算,哪位大大知道他们是怎么做的?是不是确实NAMD和Gamess不能结合?
(2)Gamess/Tinker这个QM/MM组合如何,好像不是很流行。Tinker5可以并行,不如NAMD快吧?
(3)Gromacs/Gamess这个QM/MM组合怎样?它们的相关文档多不多?容易上手不?
这是我的三个问题,请各位大大解答,每个问题3个金币,一共9个,希望大家不吝赐教,感谢先 返回小木虫查看更多
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why not try NWCHEM
http://www.nwchem-sw.org/
i am sure you will like it
NWChem就是为并行而生的。提到这个,Gaussian应该无地自容
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我在用Amber做QM/MM的计算。
目前QM部分是半经验的AM1,PM3,SCC-DFTB等。