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求助,怎么计算AMBER轨迹的SASA?

作者 cfmzxf84
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求助,用AMBER跑完了动力学,想计算下蛋白的SASA变化,请问怎么计算?
命令和in文件怎么写啊?
谢谢 返回小木虫查看更多

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  • 精华评论
  • zmz148002989

    VMD 载入轨迹,用TCL 脚本命令就可以计算

  • cfmzxf84

    引用回帖:
    2楼: Originally posted by zmz148002989 at 2012-07-18 20:48:36
    VMD 载入轨迹,用TCL 脚本命令就可以计算

    请问能给个TCL脚本吗 ?谢谢

  • zmz148002989

    VMD中 可以用measure SASA  命令直接计算。脚本的其他部分需要根据你的体系自己添加。 核心部分就是measure SASA语句

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