真菌（青霉）纯化问题
我有一株真菌，通过ITS比对，是青霉，但在PDA生长很慢，而且只长孢子，所以纯化很麻烦，我纯得一株。接种菌块，在试管里培养得打孢子种子液，用孢子液涂布平板，长出来的菌落，在同一个平板上，开始都是一样的白色菌落，培养一段时间，原本一样的菌落表现出有不同的菌落特征，分别挑起不同菌落培养，提取DNA，扩ITS，测序比对，原来在同一块平板上的不同菌落菌，测序结果，比对后同源性很高，应该是同一株菌。
有没有人遇到这样类似的情况？
照片在下；
不同菌落照片改天补上；
补上两个不同菌落图片，两个菌ITS序列同源性很高95%，从20-510的碱基序列全部相同。
[ Last edited by Hannet on 2011-6-30 at 11:56 ]
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京公网安备 11010802022153号
在同一种培养基的平板上形态不同，就表示各自基因间有差别，所以就不能称为同一株菌株。但是可能为同一种，因为分类学上种下面还有亚种和变种。
怪不得我测他们的ITS（500bp）几乎一样，那有没有什么分子手段区分鉴别他们？
ITS鉴定是存在争议的，既然菌落形态不同，那么仅凭某一个片段的DNA可能也难以表现出足够的差异，或许要更多的鉴定方式。你的这个实验是不是一定要鉴定清楚这三个菌株的种？因为往后鉴定可能要花更多的钱。
可能不是亚种变种的问题，只是简单的平板营养的问题，比如说大的菌落的地方营养就贫乏，引起霉菌的形态就会略有不同。它们基因组间是没有区别的，但是活跃的基因有差别
[ Last edited by ganchao1776 on 2011-8-18 at 00:02 ]
，
你遇到过这样的事情？能不能放照片出来让大家学习一下？
没事你试试吧，这种情况很常见的，如果你仔细观察的话同一块平板上的每一个菌落都不一样的，你能依据这个说他们是不同的亚种吗？图片我没有，信不信由你
孢子分离的有个问题，是有性产物，后代表型可能会有小小的差异的。ITS有差异应该是测序的问题了。