【求助】晶体中手性的问题?高人请进,金币不是问题!!!
自己合成出一个新的有机化合物,含有一个手性中心,未经拆分即为
消旋体(R和S的混合物),将这个消旋体进行单晶培养,并进行了测量。
疑问1:这个单晶是单纯的R体?单纯的S体?还是消旋体(R和S的混合物)?
该怎么鉴别呢?
2: 我个人怀疑我的这个单晶为消旋体(R和S的混合物),我还想拿其发文章,JMS期刊的(拿混旋体发文章可以吗?),但很害怕审稿人问手性的问题,到时候确实不知道怎么回答才好。
高手帮帮我吧,很是担心,怎么解决?怎么回答好呢?
以前为过类似问题,可始终没有准确答案。
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京公网安备 11010802022153号
这个没关系吗,不嫌麻烦就测一下旋光,各向异性等性质。嫌麻烦就看看你的单晶数据就行了,手性晶体解出来是手性空间群吗,看看不就成了。是手性就看看FLACK参数,不是就直接正常处理了。
我做个两个单晶,数据如下:这两个都是手性空间群吗?是手性分子吗?分别看了cif何LST,为找到Flank参数啊,新手请多多指教。
(我是拿两个消旋体培养的单晶并进行了测量,不知测得的单晶是R ,S 还是R和S混合体)
1
_symmetry_cell_setting Monoclinic
_symmetry_space_group_name_H-M 'C 2/c'
_symmetry_space_group_name_Hall '-C 2yc'
2
_symmetry_cell_setting Trigonal
_symmetry_space_group_name_H-M R-3
_symmetry_space_group_name_Hall '-R 3'
,
我记得 C2/c 和 R-3 都不是手性群。
那您的意思就是这两个单晶数据都没有Flanck参数了?
不过我有一点不是太明白:我培养时确实是拿混旋体培养的单晶,那么培养出来的单晶肯定是单纯的R体或单纯的S体或R和S的混合体这三种情况中的一种吧?
我的这两个单晶到底时那种呢?我该如何去看呢?
这两个单晶的cif在Check网站核查时,均提示我均是R体。对吗?我不因该相信吧?可我有不知如何去看属于三种情况中的那种。
望高手帮帮我啊?
这个空间群具有手性,不一定该晶体具有手性
就空间群来说,你的晶体应该不是手性化合物,所以找不到Flack参数也就很正常了。
在cif文件中是这两行:
'Flack H D (1983), Acta Cryst. A39, 876-881'
_refine_ls_abs_structure_Flack -0.06(8)
Flack 因子接近0,绝对构型正确;接近1绝对构型定反需要翻转;在0.5左右可能是倒反孪晶。
根据我的经验你的问题不是绝对构型是否定对,而是是否存在共结晶的问题。
如果投文章时,审稿人问到我的晶体究竟是R,S还是R和S的混合体?我该如何回答呢?