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【求助】晶体中手性的问题?高人请进,金币不是问题!!!

作者 baiyuefei
来源: 小木虫 1300 26 举报帖子
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自己合成出一个新的有机化合物,含有一个手性中心,未经拆分即为
消旋体(R和S的混合物),将这个消旋体进行单晶培养,并进行了测量。

疑问1:这个单晶是单纯的R体?单纯的S体?还是消旋体(R和S的混合物)?
      该怎么鉴别呢?

    2: 我个人怀疑我的这个单晶为消旋体(R和S的混合物),我还想拿其发文章,JMS期刊的(拿混旋体发文章可以吗?),但很害怕审稿人问手性的问题,到时候确实不知道怎么回答才好。

高手帮帮我吧,很是担心,怎么解决?怎么回答好呢?
以前为过类似问题,可始终没有准确答案。 返回小木虫查看更多

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  • 精华评论
  • vink

    这个没关系吗,不嫌麻烦就测一下旋光,各向异性等性质。嫌麻烦就看看你的单晶数据就行了,手性晶体解出来是手性空间群吗,看看不就成了。是手性就看看FLACK参数,不是就直接正常处理了。

  • baiyuefei

    引用回帖:
    Originally posted by vink at 2011-03-10 17:24:30:
    这个没关系吗,不嫌麻烦就测一下旋光,各向异性等性质。嫌麻烦就看看你的单晶数据就行了,手性晶体解出来是手性空间群吗,看看不就成了。是手性就看看FLACK参数,不是就直接正常处理了。

    我做个两个单晶,数据如下:这两个都是手性空间群吗?是手性分子吗?分别看了cif何LST,为找到Flank参数啊,新手请多多指教。
    (我是拿两个消旋体培养的单晶并进行了测量,不知测得的单晶是R ,S 还是R和S混合体)
    1

    _symmetry_cell_setting            Monoclinic
    _symmetry_space_group_name_H-M    'C 2/c'
    _symmetry_space_group_name_Hall   '-C 2yc'

    2
    _symmetry_cell_setting            Trigonal
    _symmetry_space_group_name_H-M    R-3
    _symmetry_space_group_name_Hall   '-R 3'

  • rebuild8586

    引用回帖:
    Originally posted by baiyuefei at 2011-03-10 17:31:22:
    我做个两个单晶,数据如下:这两个都是手性空间群吗?是手性分子吗?分别看了cif何LST,为找到Flank参数啊,新手请多多指教。
    (我是拿两个消旋体培养的单晶并进行了测量,不知测得的单晶是R ,S 还是R和S混合体 ...

    我记得 C2/c 和 R-3 都不是手性群。

  • baiyuefei

    引用回帖:
    Originally posted by rebuild8586 at 2011-03-10 17:39:06:
    我记得 C2/c 和 R-3 都不是手性群。

    那您的意思就是这两个单晶数据都没有Flanck参数了?
    不过我有一点不是太明白:我培养时确实是拿混旋体培养的单晶,那么培养出来的单晶肯定是单纯的R体或单纯的S体或R和S的混合体这三种情况中的一种吧?

    我的这两个单晶到底时那种呢?我该如何去看呢?

    这两个单晶的cif在Check网站核查时,均提示我均是R体。对吗?我不因该相信吧?可我有不知如何去看属于三种情况中的那种。
    望高手帮帮我啊?

  • hardy2709

    引用回帖:
    Originally posted by vink at 2011-03-10 17:24:30:
    这个没关系吗,不嫌麻烦就测一下旋光,各向异性等性质。嫌麻烦就看看你的单晶数据就行了,手性晶体解出来是手性空间群吗,看看不就成了。是手性就看看FLACK参数,不是就直接正常处理了。

    这个空间群具有手性,不一定该晶体具有手性

  • zhaoyangqufu

    引用回帖:
    Originally posted by baiyuefei at 2011-03-10 17:46:47:
    那您的意思就是这两个单晶数据都没有Flanck参数了?
    不过我有一点不是太明白:我培养时确实是拿混旋体培养的单晶,那么培养出来的单晶肯定是单纯的R体或单纯的S体或R和S的混合体这三种情况中的一种吧?

    我的 ...

    就空间群来说,你的晶体应该不是手性化合物,所以找不到Flack参数也就很正常了。

  • xuanyuanjie

    在cif文件中是这两行:

    'Flack H D (1983), Acta Cryst. A39, 876-881'
    _refine_ls_abs_structure_Flack    -0.06(8)

    Flack 因子接近0,绝对构型正确;接近1绝对构型定反需要翻转;在0.5左右可能是倒反孪晶。

    根据我的经验你的问题不是绝对构型是否定对,而是是否存在共结晶的问题。

  • baiyuefei

    引用回帖:
    Originally posted by zhaoyangqufu at 2011-03-10 18:35:50:
    就空间群来说,你的晶体应该不是手性化合物,所以找不到Flack参数也就很正常了。

    如果投文章时,审稿人问到我的晶体究竟是R,S还是R和S的混合体?我该如何回答呢?

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