所述方法毫无疑问可以用来加快分子稳定构型的搜索。但用这一方法得到整个大分子的稳定构型后，还得作一次全局优化，否则就得看审稿人的脸色啦（我有一位同事就遇到过这样的问题），

不知道总的计算体系有多少原子 多少重原子，LZ所述方法在我看来适合机理猜测以及印证实验，如果真的要发文章的话，建议你对全模型进行计算，减少计算量的方法可以通过使用混合基组，ONIOM等完成。高档次的杂志，reviewer很挑剔。